RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491659.5

USP39-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 3

Gene USP39, Length 648 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-217ENST00000491659 ANAPC5Q9UJX4 755 aa14.72□□□□□ -0.05
USP39-217ENST00000491659 TLCD2A6NGC4 264 aa14.71□□□□□ -0.05
USP39-217ENST00000491659 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
USP39-217ENST00000491659 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
USP39-217ENST00000491659 STK17BO94768 372 aa14.71□□□□□ -0.05
USP39-217ENST00000491659 TPSB2P20231 275 aa14.71□□□□□ -0.05
USP39-217ENST00000491659 CD151P48509 253 aa14.71□□□□□ -0.05
USP39-217ENST00000491659 ARL4DP49703 201 aa14.71□□□□□ -0.05
USP39-217ENST00000491659 PRKAA1Q13131 559 aa14.71□□□□□ -0.05
USP39-217ENST00000491659 TPSAB1Q15661 275 aa14.71□□□□□ -0.05
USP39-217ENST00000491659 SYTL3Q4VX76 610 aa14.71□□□□□ -0.05
USP39-217ENST00000491659 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
USP39-217ENST00000491659 PCID2Q5JVF3 399 aa14.71□□□□□ -0.05
USP39-217ENST00000491659 NLGN4XQ8N0W4 816 aa14.71□□□□□ -0.05
USP39-217ENST00000491659 PRELID2Q8N945 189 aa14.71□□□□□ -0.05
USP39-217ENST00000491659 ACVR1CQ8NER5 493 aa14.71□□□□□ -0.05
USP39-217ENST00000491659 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
USP39-217ENST00000491659 KLHL6Q8WZ60 621 aa14.71□□□□□ -0.05
USP39-217ENST00000491659 ELMO1Q92556 727 aa14.71□□□□□ -0.05
USP39-217ENST00000491659 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
USP39-217ENST00000491659 OR6C1Q96RD1 312 aa14.71□□□□□ -0.05
USP39-217ENST00000491659 FERD3LQ96RJ6 166 aa14.71□□□□□ -0.05
USP39-217ENST00000491659 IL22Q9GZX6 179 aa14.71□□□□□ -0.05
USP39-217ENST00000491659 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
USP39-217ENST00000491659 HRASLS2Q9NWW9 162 aa14.71□□□□□ -0.05
USP39-217ENST00000491659 BFARQ9NZS9 450 aa14.71□□□□□ -0.05
USP39-217ENST00000491659 PILRAQ9UKJ1 303 aa14.71□□□□□ -0.05
USP39-217ENST00000491659 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa14.71□□□□□ -0.05
USP39-217ENST00000491659 PRSS21Q9Y6M0 314 aa14.71□□□□□ -0.05
USP39-217ENST00000491659 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 OR6C74A6NCV1 312 aa14.7□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 MATN2O00339 956 aa14.7□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 NELFEP18615 380 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 PREPP48147 710 aa14.7□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 NPY2RP49146 381 aa14.7□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 SH3BP2P78314 561 aa14.7□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 SARNPP82979 210 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 CDK16Q00536 496 aa14.7□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 IL11RAQ14626 422 aa14.7□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 KMT5CQ86Y97 462 aa14.7□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 RASGRP3Q8IV61 690 aa14.7□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 RASGEF1CQ8N431 466 aa14.7□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 LCN9Q8WX39 176 aa14.7□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 TTC9Q92623 222 aa14.7□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 WBP1Q96G27 269 aa14.7□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 ZNF778Q96MU6 729 aa14.7□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 TSSK1BQ9BXA7 367 aa14.7□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 ULBP3Q9BZM4 244 aa14.7□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 MVB12BQ9H7P6 319 aa14.7□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 CATSPERZQ9NTU4 200 aa14.7□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa14.69□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 KIF5CO60282 957 aa14.69□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 LIFP15018 202 aa14.69□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 PDHA2P29803 388 aa14.69□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 VPS41P49754 854 aa14.69□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 TUBB3Q13509 450 aa14.69□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 MAP7Q14244 749 aa14.69□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 ZNF534Q76KX8 674 aa14.69□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.69□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 CARFQ8N187 725 aa14.69□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 SLC35F6Q8N357 371 aa14.69□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 OR4E2Q8NGC2 313 aa14.69□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 SGSM3Q96HU1 749 aa14.69□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 MS4A14Q96JA4 679 aa14.69□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 ELMO2Q96JJ3 720 aa14.69□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 MAP3K3Q99759 626 aa14.69□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 HGH1Q9BTY7 390 aa14.69□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 SRMSQ9H3Y6 488 aa14.69□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 PDE7BQ9NP56 450 aa14.69□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 CHRAC1Q9NRG0 131 aa14.69□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 SEMA5BQ9P283 1151 aa14.69□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa14.68□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 GSAPA4D1B5 854 aa14.68□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 OR1I1O60431 355 aa14.68□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 DLGAP3O95886 979 aa14.68□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 KRT14P02533 472 aa14.68□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 FGF5P12034 268 aa14.68□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 MGAT1P26572 445 aa14.68□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 TTPAP49638 278 aa14.68□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 TERF1P54274 439 aa14.68□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 CRADDP78560 199 aa14.68□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 HSD11B2P80365 405 aa14.68□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 ACY1Q03154 408 aa14.68□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 GPS1Q13098 491 aa14.68□□□□□ -0.06
USP39-217ENST00000491659 BRD3Q15059 726 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms