RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490705.1

ARF1-211, Transcript of ADP ribosylation factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene ARF1, Length 881 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF1-211ENST00000490705 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 MPP5Q8N3R9 675 aa13.06□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 MCUQ8NE86 351 aa13.06□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 ZFPM2Q8WW38 1151 aa13.06□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 MFSD3Q96ES6 412 aa13.06□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 ZDHHC12Q96GR4 267 aa13.06□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 C9orf72Q96LT7 481 aa13.06□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 OR52A5Q9H2C5 316 aa13.06□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa13.06□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 SLC39A1Q9NY26 324 aa13.06□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 ASIC3Q9UHC3 531 aa13.06□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 SLC24A2Q9UI40 661 aa13.06□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 ACSL6Q9UKU0 697 aa13.06□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 VAPBO95292 243 aa13.05□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 LIPCP11150 499 aa13.05□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 MLNP12872 115 aa13.05□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 ITGB6P18564 788 aa13.05□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 PAMP19021 973 aa13.05□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 CD82P27701 267 aa13.05□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 SEPHS1P49903 392 aa13.05□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 RAB15P59190 212 aa13.05□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 CLN3Q13286 438 aa13.05□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 CACHD1Q5VU97 1274 aa13.05□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 NAPRTQ6XQN6 538 aa13.05□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 FAM92BQ6ZTR7 304 aa13.05□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 PDZD3Q86UT5 571 aa13.05□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 OOSP2Q86WS3 158 aa13.05□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 ZFAND4Q86XD8 727 aa13.05□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 PPIL6Q8IXY8 311 aa13.05□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 PMEPA1Q969W9 287 aa13.05□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 SERPINB12Q96P63 405 aa13.05□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 FERD3LQ96RJ6 166 aa13.05□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 TSSK1BQ9BXA7 367 aa13.05□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 B3GNT4Q9C0J1 378 aa13.05□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 EPHA6Q9UF33 1036 aa13.05□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa13.05□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa13.05□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 SDK2Q58EX2 2172 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 OR6C74A6NCV1 312 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 OR5K3A6NET4 321 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 GOLGA8KD6RF30 607 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 GOLGA8TH3BQL2 631 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 NDUFS3O75489 264 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 ARNTP27540 789 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 PAFAH1B1P43034 410 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 CD151P48509 253 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 UCNP55089 124 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 TMPRSS3P57727 454 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 PPP1CAP62136 330 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 CXADRP78310 365 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 PTK6Q13882 451 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 DCAF12Q5T6F0 453 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 ARMC3Q5W041 872 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 ANKS6Q68DC2 871 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 MRNIPQ6NTE8 343 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 ARMC6Q6NXE6 501 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 PRSS42Q7Z5A4 293 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 CREG2Q8IUH2 290 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 KLHL7Q8IXQ5 586 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 BMPERQ8N8U9 685 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 NAT8LQ8N9F0 302 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 PHC3Q8NDX5 983 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 ACVR1CQ8NER5 493 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 LCN9Q8WX39 176 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 CTRCQ99895 268 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 HGH1Q9BTY7 390 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 DDA1Q9BW61 102 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 RAB33BQ9H082 229 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 HRASLS2Q9NWW9 162 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 PCYOX1Q9UHG3 505 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa13.04□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa13.03□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 SLC5A10A0PJK1 596 aa13.03□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 SDR42E2A6NKP2 422 aa13.03□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 IQCF5A8MTL0 148 aa13.03□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 STMND1H3BQB6 276 aa13.03□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 PFDN6O15212 129 aa13.03□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 MC2RQ01718 297 aa13.03□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 FOXM1Q08050 763 aa13.03□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 PRKG2Q13237 762 aa13.03□□□□□ -0.32
ARF1-211ENST00000490705 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms