RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485692.1

GTF3C5-209, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 5, humanhuman

TSL 2

Gene GTF3C5, Length 827 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5-209ENST00000485692 TUBB4BP68371 445 aa20.4■□□□□ 0.86
GTF3C5-209ENST00000485692 KIF5AQ12840 1032 aa20.4■□□□□ 0.86
GTF3C5-209ENST00000485692 DNASE1L3Q13609 305 aa20.4■□□□□ 0.86
GTF3C5-209ENST00000485692 TUBB2AQ13885 445 aa20.4■□□□□ 0.86
GTF3C5-209ENST00000485692 ERV3-1Q14264 604 aa20.4■□□□□ 0.86
GTF3C5-209ENST00000485692 P3H1Q32P28 736 aa20.4■□□□□ 0.86
GTF3C5-209ENST00000485692 FAM71DQ8N9W8 422 aa20.4■□□□□ 0.86
GTF3C5-209ENST00000485692 ACVR1CQ8NER5 493 aa20.4■□□□□ 0.86
GTF3C5-209ENST00000485692 OR8K5Q8NH50 307 aa20.4■□□□□ 0.86
GTF3C5-209ENST00000485692 ABHD17AQ96GS6 310 aa20.4■□□□□ 0.86
GTF3C5-209ENST00000485692 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
GTF3C5-209ENST00000485692 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.4■□□□□ 0.86
GTF3C5-209ENST00000485692 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa20.4■□□□□ 0.86
GTF3C5-209ENST00000485692 ANAPC2Q9UJX6 822 aa20.4■□□□□ 0.86
GTF3C5-209ENST00000485692 POLHQ9Y253 713 aa20.4■□□□□ 0.86
GTF3C5-209ENST00000485692 KCNMB2Q9Y691 235 aa20.4■□□□□ 0.86
GTF3C5-209ENST00000485692 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa20.39■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 MATN2O00339 956 aa20.39■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 CCL22O00626 93 aa20.39■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 CREG1O75629 220 aa20.39■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 ACRV1P26436 265 aa20.39■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 TLE1Q04724 770 aa20.39■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 PRKAA1Q13131 559 aa20.39■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa20.39■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 TMTC4Q5T4D3 741 aa20.39■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 ZNF449Q6P9G9 518 aa20.39■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 CT55Q8WUE5 264 aa20.39■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 SEC14L1Q92503 715 aa20.39■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa20.38■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 PSMD3O43242 534 aa20.38■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 METTL18O95568 372 aa20.38■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 GSTM1P09488 218 aa20.38■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 GSTM4Q03013 218 aa20.38■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 CERS6Q6ZMG9 384 aa20.38■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 SERPINA9Q86WD7 417 aa20.38■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 OR4E2Q8NGC2 313 aa20.38■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 LCN9Q8WX39 176 aa20.38■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 GPR87Q9BY21 358 aa20.38■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 TWSG1Q9GZX9 223 aa20.38■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 SRMSQ9H3Y6 488 aa20.38■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 COG4Q9H9E3 785 aa20.38■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 SOHLH2Q9NX45 425 aa20.38■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 BTRCQ9Y297 605 aa20.38■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 PIPSLA2A3N6 862 aa20.37■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 FTCDO95954 541 aa20.37■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 NTRK1P04629 796 aa20.37■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 TPH1P17752 444 aa20.37■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 CASRP41180 1078 aa20.37■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 CD151P48509 253 aa20.37■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 CACNG1Q06432 222 aa20.37■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 RPA4Q13156 261 aa20.37■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 POU6F1Q14863 301 aa20.37■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 TAS2R42Q7RTR8 314 aa20.37■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 TMEM126BQ8IUX1 230 aa20.37■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.37■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 STYXQ8WUJ0 223 aa20.37■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 ALS2CR12Q96Q35 445 aa20.37■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 FERD3LQ96RJ6 166 aa20.37■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 TMEM121Q9BTD3 319 aa20.37■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 OR52A5Q9H2C5 316 aa20.37■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 ACTL8Q9H568 366 aa20.37■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 FANCEQ9HB96 536 aa20.37■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 LATS2Q9NRM7 1088 aa20.37■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 KCND1Q9NSA2 647 aa20.37■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 POMT2Q9UKY4 750 aa20.37■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 CDC14CA4D256 554 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 MKRN2OSH3BPM6 223 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 SCRG1O75711 98 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 AP2A1O95782 977 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 FURINP09958 794 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 CDH3P22223 829 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 GDF10P55107 478 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 GPR19Q15760 415 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 SKIDA1Q1XH10 827 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 TMEM139Q8IV31 216 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 EPN3Q9H201 632 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 MVB12BQ9H7P6 319 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 C1GALT1Q9NS00 363 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 GSAPA4D1B5 854 aa20.35■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 AP2A2O94973 939 aa20.35■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 RPS15P62841 145 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 LINC00523Q86TU6 105 aa20.35■□□□□ 0.85
GTF3C5-209ENST00000485692 HES6Q96HZ4 224 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms