RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479043.1

ANKRD28-210, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-210ENST00000479043 ARF1P84077 181 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 IRF3Q14653 427 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 SLC1A5Q15758 541 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 CCDC184Q52MB2 194 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 JADE1Q6IE81 842 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 KLHL35Q6PF15 583 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 PACS1Q6VY07 963 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 CFAP77Q6ZQR2 320 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 SLC5A8Q8N695 610 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 EMC1Q8N766 993 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 STPG4Q8N801 248 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 SMC6Q96SB8 1091 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 SDF4Q9BRK5 362 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 GPR34Q9UPC5 381 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 PTPRTO14522 1441 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 NEURL4Q96JN8 1562 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 MADDQ8WXG6 1647 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 OR2M5A3KFT3 312 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 TMEM8BA6NDV4 472 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 PTGES3LE9PB15 166 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 AP3D1O14617 1153 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 AHCYL1O43865 530 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 ZNF217O75362 1048 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 LDHCP07864 332 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 NR2F2P24468 414 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 ALDH4A1P30038 563 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 PMP22Q01453 160 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 CREB5Q02930 508 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 LRMPQ12912 555 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 NAB2Q15742 525 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 SPATA1Q5VX52 437 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 C16orf54Q6UWD8 224 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 TPRG1Q6ZUI0 275 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 LONP2Q86WA8 852 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 OR8K5Q8NH50 307 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 PPP4R1Q8TF05 950 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 SMPDL3BQ92485 455 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 CMTM3Q96MX0 182 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 BARHL1Q9BZE3 327 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 TRPC7Q9HCX4 862 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 SLC52A3Q9NQ40 469 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 SETD4Q9NVD3 440 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 HAUS2Q9NVX0 235 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 TERF2IPQ9NYB0 399 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 CCDC144AA2RUR9 1427 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 ATP7AQ04656 1500 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 CLTCL1P53675 1640 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 TET3O43151 1660 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 H0YIN7 160 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 VILLO15195 856 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 SLC22A2O15244 555 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 OGG1O15527 345 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 GCNT3O95395 438 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 TFAP2AP05549 437 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 TSPY4P0CV99 314 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 TSPY10P0CW01 314 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 PRSS56P0CW18 603 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 ACTN1P12814 892 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 GNB3P16520 340 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 GABRB1P18505 474 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 MSH3P20585 1137 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 PIK3CAP42336 1068 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 IQGAP1P46940 1657 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 DUSP28Q4G0W2 176 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 EFCAB6Q5THR3 1501 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-210ENST00000479043 ACSM2BQ68CK6 577 aa3.06□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms