RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467065.1

UBXN4-205, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN4, Length 334 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-205ENST00000467065 CRYMQ14894 314 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN4-205ENST00000467065 INSCQ1MX18 579 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN4-205ENST00000467065 TBC1D25Q3MII6 688 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN4-205ENST00000467065 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
UBXN4-205ENST00000467065 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN4-205ENST00000467065 FOXR1Q6PIV2 292 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN4-205ENST00000467065 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.5□□□□□ -1.37
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UBXN4-205ENST00000467065 OTOAQ7RTW8 1153 aa6.5□□□□□ -1.37
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UBXN4-205ENST00000467065 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN4-205ENST00000467065 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN4-205ENST00000467065 TAF8Q7Z7C8 310 aa6.5□□□□□ -1.37
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UBXN4-205ENST00000467065 AMZ2Q86W34 360 aa6.5□□□□□ -1.37
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UBXN4-205ENST00000467065 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.5□□□□□ -1.37
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UBXN4-205ENST00000467065 GPR26Q8NDV2 337 aa6.5□□□□□ -1.37
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UBXN4-205ENST00000467065 VPS35Q96QK1 796 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN4-205ENST00000467065 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.5□□□□□ -1.37
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UBXN4-205ENST00000467065 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa6.5□□□□□ -1.37
UBXN4-205ENST00000467065 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
UBXN4-205ENST00000467065 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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UBXN4-205ENST00000467065 UGT1A8Q9HAW9 530 aa6.5□□□□□ -1.37
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UBXN4-205ENST00000467065 LRP8Q14114 963 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN4-205ENST00000467065 SLC29A2Q14542 456 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN4-205ENST00000467065 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
UBXN4-205ENST00000467065 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN4-205ENST00000467065 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
UBXN4-205ENST00000467065 LVRNQ6Q4G3 990 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN4-205ENST00000467065 TMEM220Q6QAJ8 160 aa6.49□□□□□ -1.37
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