RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 BRWD1Q9NSI6 2320 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 LAMA3Q16787 3333 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CDH23Q9H251 3354 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 C5orf42Q9H799 3197 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PCM1Q15154 2024 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PRORSD1PA6NEY8 169 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 C16orf96A6NNT2 1141 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 BBIP1A8MTZ0 92 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 E7ENX8 843 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 H0Y3Z8 333 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 H0Y858 1186 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ARNTLO00327 626 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM38O00635 465 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 AIM2O14862 343 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PER2O15055 1255 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 LSM1O15116 133 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 NPC1O15118 1278 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SLC16A5O15375 505 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PEX1O43933 1283 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 LEFTY1O75610 366 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ATP6AP2O75787 350 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CIB2O75838 187 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SLCO2B1O94956 709 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 OR4F21O95013 312 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ADH1CP00326 375 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 C8BP07358 591 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 IDO1P14902 403 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 EZRP15311 586 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ACADSP16219 412 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 LBPP18428 481 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CHRM3P20309 590 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ATP6V1C1P21283 382 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ITGB7P26010 798 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 IL12AP29459 219 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CA8P35219 290 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 OPRD1P41143 372 aa5.54□□□□□ -1.52
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PTPRC-210ENST00000462363 RGS4P49798 205 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 METAP1P53582 386 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 DIO3P55073 304 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PSME3P61289 254 aa5.54□□□□□ -1.52
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PTPRC-210ENST00000462363 SP140Q13342 867 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SHHQ15465 462 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 MAPRE2Q15555 327 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SMU1Q2TAY7 513 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
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PTPRC-210ENST00000462363 SPATS1Q496A3 300 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 GGTA1PQ4G0N0 100 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 AGKQ53H12 422 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 C2orf27AQ580R0 203 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC73Q5JTD7 316 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 C9orf64Q5T6V5 341 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 C1orf146Q5VVC0 180 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM68Q6AZZ1 485 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 REP15Q6BDI9 236 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 NXNQ6DKJ4 435 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SYCE2Q6PIF2 218 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PAOXQ6QHF9 649 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 LIPIQ6XZB0 460 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 Q6ZVL8 140 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM46Q7Z4K8 759 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 GPR149Q86SP6 731 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 GALNT13Q8IUC8 556 aa5.54□□□□□ -1.52
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PTPRC-210ENST00000462363 SFTPA1Q8IWL2 248 aa5.54□□□□□ -1.52
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PTPRC-210ENST00000462363 SFRP1Q8N474 314 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 MINDY1Q8N5J2 469 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 DPP10Q8N608 796 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SNX31Q8N9S9 440 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TMIEQ8NEW7 156 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 KCNV2Q8TDN2 545 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 FGF13Q92913 245 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SMARCD2Q92925 531 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 USP7Q93009 1102 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SCAMP4Q969E2 229 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ESAMQ96AP7 390 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PBXIP1Q96AQ6 731 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 FAM131CQ96AQ9 280 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ARRDC3Q96B67 414 aa5.54□□□□□ -1.52
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