RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451349.1

SSXP4-201, Transcript of SSX family pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene SSXP4, Length 245 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSXP4-201ENST00000451349 SERPINB6P35237 376 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 TRIM23P36406 574 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 SPAM1P38567 509 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 GSTM5P46439 218 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 SELENOPP49908 381 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 ATP12AP54707 1039 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 B4GALNT1Q00973 533 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 ACSM2AQ08AH3 577 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 KLF10Q13118 480 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 DRP2Q13474 957 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 RUNX2Q13950 521 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 PDIA5Q14554 519 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 IQCB1Q15051 598 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 MAPRE2Q15555 327 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 SNCBQ16143 134 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 TBR1Q16650 682 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 SYT16Q17RD7 645 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 MPPE1Q53F39 396 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 SPANXN2Q5MJ10 180 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 PHYHD1Q5SRE7 291 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 C9orf50Q5SZB4 431 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 ACSM2BQ68CK6 577 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 ZNF585AQ6P3V2 769 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 LAYNQ6UX15 382 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 ABHD15Q6UXT9 468 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 LEKR1Q6ZMV7 388 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 TPGS1Q6ZTW0 290 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 TAS1R1Q7RTX1 841 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 KRT27Q7Z3Y8 459 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 USP37Q86T82 979 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 NRROSQ86YC3 692 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 PLXDC1Q8IUK5 500 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 GHDCQ8N2G8 530 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 SLC25A41Q8N5S1 370 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 TMEM185AQ8NFB2 350 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 OR2T3Q8NH03 318 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 CFAP61Q8NHU2 1237 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 CDC26Q8NHZ8 85 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 Q8TCH9 128 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 SLC2A14Q8TDB8 520 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 ASZ1Q8WWH4 475 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 OIT3Q8WWZ8 545 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 OVCA2Q8WZ82 227 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 FIG4Q92562 907 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 KIFAP3Q92845 792 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 RHBDF1Q96CC6 855 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 SLC41A3Q96GZ6 507 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 C12orf66Q96MD2 445 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 WDR92Q96MX6 357 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 OR2A14Q96R47 310 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 OR14A2Q96R54 314 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 ASCL2Q99929 193 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 KCNS3Q9BQ31 491 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 FAM213AQ9BRX8 229 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 ZNF577Q9BSK1 485 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 FICDQ9BVA6 458 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 SLC46A2Q9BY10 475 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 TTYH3Q9C0H2 523 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 CTDSP1Q9GZU7 261 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 CLPBQ9H078 707 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 MMP27Q9H306 513 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 UBQLN3Q9H347 655 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 LDAHQ9H6V9 325 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 MVB12BQ9H7P6 319 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 MINDY3Q9H8M7 445 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 USP29Q9HBJ7 922 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 GPR35Q9HC97 309 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 TRPC7Q9HCX4 862 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 CHRAC1Q9NRG0 131 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 THAP1Q9NVV9 213 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 FKBP14Q9NWM8 211 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 SLC39A1Q9NY26 324 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 MOCS1Q9NZB8 636 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 PEMTQ9UBM1 199 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 MGAT4CQ9UBM8 478 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 MGAT4BQ9UQ53 548 aa3.35□□□□□ -1.87
SSXP4-201ENST00000451349 RCE1Q9Y256 329 aa3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms