RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 ETNK1Q9HBU6 452 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 INIPQ9NRY2 104 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 CHMP2BQ9UQN3 213 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 ALG6Q9Y672 507 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 UNC13CQ8NB66 2214 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 CFAP46Q8IYW2 2715 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 PMS2P1A4D2B8 440 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRR-204ENST00000440835 PSTPIP1O43586 416 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRR-204ENST00000440835 DTX3LQ8TDB6 740 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRR-204ENST00000440835 GBP5Q96PP8 586 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM237Q96Q45 408 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRR-204ENST00000440835 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 WDR37Q9Y2I8 494 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 LRCH1Q9Y2L9 728 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRR-204ENST00000440835 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 A0A0J9YVX5 310 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRR-204ENST00000440835 RGRP47804 291 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 STC1P52823 247 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRR-204ENST00000440835 VSIG1Q86XK7 387 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRR-204ENST00000440835 NAGSQ8N159 534 aa5.93□□□□□ -1.46
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PTPRR-204ENST00000440835 KCND3Q9UK17 655 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 PILRAQ9UKJ1 303 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 A0A0J9YYE9 177 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 SMIM23A6NLE4 172 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 TCP11X1B4DZS4 312 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 INPP4BO15327 924 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 MAFKO60675 156 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 PEX11BO96011 259 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 TRBC1P01850 177 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 C9P02748 559 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 FAM87AP0C7U9 286 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 LIFP15018 202 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRR-204ENST00000440835 ALDH4A1P30038 563 aa5.92□□□□□ -1.46
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