RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 SEPHS2Q99611 448 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 TOR3AQ9H497 397 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 NTN4Q9HB63 628 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 TRANK1O15050 2925 aa16.59■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 MYO7AQ13402 2215 aa16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 NEMP2A6NFY4 417 aa16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 TGM5O43548 720 aa16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 MFSD11O43934 449 aa16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 NCK1P16333 377 aa16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 CAPN3P20807 821 aa16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 NOS2P35228 1153 aa16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 TUFMP49411 452 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 LSM3P62310 102 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF460Q14592 562 aa16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 PYCR3Q53H96 274 aa16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 STEAP3Q658P3 488 aa16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 DESI1Q6ICB0 168 aa16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 TUBA3EQ6PEY2 450 aa16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 PRR23CQ6ZRP0 262 aa16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 FKBP9P1Q75LS8 142 aa16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 STRADAQ7RTN6 431 aa16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 IFNEQ86WN2 208 aa16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 TCEAL8Q8IYN2 117 aa16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 CCNYQ8ND76 341 aa16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 ANGPTL6Q8NI99 470 aa16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 FAR1Q8WVX9 515 aa16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 EDEM1Q92611 657 aa16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM125Q96AQ2 219 aa16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 ALG2Q9H553 416 aa16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 FAM118AQ9NWS6 357 aa16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF221Q9UK13 617 aa16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 YIPF1Q9Y548 306 aa16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-205ENST00000436404 OBSL1O75147 1896 aa16.58■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa16.58■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 SLC38A8A6NNN8 435 aa16.58■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 ATP6AP2O75787 350 aa16.58■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 MT-CO1P00395 513 aa16.58■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 KRT6AP02538 564 aa16.58■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 AHSGP02765 367 aa16.58■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 KRT6BP04259 564 aa16.58■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 SPNP16150 400 aa16.58■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 STMN1P16949 149 aa16.58■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 ARL4AP40617 200 aa16.58■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 NPY2RP49146 381 aa16.58■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 ACOX1Q15067 660 aa16.58■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 SLC25A52Q3SY17 297 aa16.58■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 CEP97Q8IW35 865 aa16.58■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 BIRC7Q96CA5 298 aa16.58■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 CCDC126Q96EE4 140 aa16.58■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 RNF145Q96MT1 663 aa16.58■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 TRIM54Q9BYV2 358 aa16.58■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa16.58■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 UBXN8O00124 270 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 UPK1AO00322 258 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 ICMTO60725 284 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 HPRP00739 348 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 ALDH4A1P30038 563 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 BMP8BP34820 402 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 SEPHS1P49903 392 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 P2RX3P56373 397 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 UGT3A2Q3SY77 523 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 CYHR1Q6ZMK1 362 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 CCDC103Q8IW40 242 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 TTLL2Q9BWV7 592 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 CCDC90BQ9GZT6 254 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 FBXO44Q9H4M3 255 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 CERS4Q9HA82 394 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 A0A1W2PQH9 124 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 PTGES3LE9PB15 166 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 H3BNC9 293 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 AP3B1O00203 1094 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 PRSS23O95084 383 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 MFN2O95140 757 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 TCF3P15923 654 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 ACVR2AP27037 513 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 EPS8Q12929 822 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 CDK10Q15131 360 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 FAM83EQ2M2I3 478 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 STK32CQ86UX6 486 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 P2RY8Q86VZ1 359 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 RIMKLAQ8IXN7 391 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 NETO2Q8NC67 525 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 SIMC1Q8NDZ2 872 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF555Q8NEP9 628 aa16.57■□□□□ 0.24
CNGA3-205ENST00000436404 HEXDCQ8WVB3 486 aa16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms