RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 DUX1O43812 170 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 KLRC4O43908 158 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 KIF5CO60282 957 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 LRCH4O75427 683 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 RFPL1O75677 317 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 CLSTN1O94985 981 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 CSF2P04141 144 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 Q6ZSR6 202 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 TRIM69Q86WT6 500 aa6.23□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 AADATQ8N5Z0 425 aa6.23□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 IL17RDQ8NFM7 739 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 OR8K1Q8NGG5 319 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 TAAR9Q96RI9 348 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 ERGIC2Q96RQ1 377 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 KCNK16Q96T55 309 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 CGRRF1Q99675 332 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 LRRN3Q9H3W5 708 aa6.23□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 ITGA11Q9UKX5 1188 aa6.23□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 CEP83Q9Y592 693 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.23□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 TOR1BO14657 336 aa6.22□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 FAM189A1O60320 539 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 RAD1O60671 282 aa6.22□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 TMEM191BP0C7N4 346 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa6.22□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 WARSP23381 471 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 NNMTP40261 264 aa6.22□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 ISM2Q6H9L7 571 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 TMCO3Q6UWJ1 677 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 SLC35F3Q8IY50 421 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 TXLNBQ8N3L3 684 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 MNS1Q8NEH6 495 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 OR6C4Q8NGE1 309 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 KLK6Q92876 244 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 HPDLQ96IR7 371 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa6.22□□□□□ -1.41
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