RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427722.2

RFX3-AS1-202, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 1,088 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-202ENST00000427722 STMND1H3BQB6 276 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 ZSCAN12O43309 604 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 KIF5CO60282 957 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 GOT2P00505 430 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 C9P02748 559 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 ANKRD34CP0C6C1 535 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 ADRA1DP25100 572 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 CD82P27701 267 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SEPHS1P49903 392 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 RAB15P59190 212 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 PRAMEP78395 509 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 LAMB3Q13751 1172 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 KRT33BQ14525 404 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 MANEAQ5SRI9 462 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 DCAF12Q5T6F0 453 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 TTC27Q6P3X3 843 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 KLHL35Q6PF15 583 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 PACS1Q6VY07 963 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 TRIM46Q7Z4K8 759 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 PRSS42Q7Z5A4 293 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 OTUD6BQ8N6M0 293 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 BMPERQ8N8U9 685 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 OR6P1Q8NGX9 317 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 COG1Q8WTW3 980 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 RNF31Q96EP0 1072 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 ZNF778Q96MU6 729 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 RANBP9Q96S59 729 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 CCM2Q9BSQ5 444 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 AP1M1Q9BXS5 423 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 HOMER3Q9NSC5 361 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 PRSS21Q9Y6M0 314 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SCN8AQ9UQD0 1980 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 OR5K3A6NET4 321 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 OR1I1O60431 355 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 AP2A2O94973 939 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 PSMA3P25788 255 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 MGAT1P26572 445 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 NSG1P42857 185 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 ATP1A2P50993 1020 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 MC2RQ01718 297 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 ACVR1Q04771 509 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 FOXM1Q08050 763 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 VAC14Q08AM6 782 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 GPS1Q13098 491 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 ITIH4Q14624 930 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SYTL3Q4VX76 610 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 CACHD1Q5VU97 1274 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 ARMC6Q6NXE6 501 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 C4orf22Q6V702 233 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 CCDC81Q6ZN84 652 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 ZNF534Q76KX8 674 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 NLRP9Q7RTR0 991 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 OOSP2Q86WS3 158 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 RASGEF1CQ8N431 466 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 ZDHHC12Q96GR4 267 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 PBKQ96KB5 322 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 OSBPL9Q96SU4 736 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 HGH1Q9BTY7 390 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 B3GNT4Q9C0J1 378 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 OR52A5Q9H2C5 316 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 APMAPQ9HDC9 416 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SYBUQ9NX95 663 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 BFARQ9NZS9 450 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 SLC24A2Q9UI40 661 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 RIMKLBQ9ULI2 386 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 MYLKQ15746 1914 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa8.98□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa8.98□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa8.98□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa8.98□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 OR6C74A6NCV1 312 aa8.98□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 USP27XA6NNY8 438 aa8.98□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 K7ENP7 123 aa8.98□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 QSOX1O00391 747 aa8.98□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-202ENST00000427722 RAD1O60671 282 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms