RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 FOPNLQ96NB1 174 aa16.59■□□□□ 0.25
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ALG9Q9H6U8 611 aa16.59■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 XPR1Q9UBH6 696 aa16.59■□□□□ 0.25
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TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa16.59■□□□□ 0.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRPM6Q9BX84 2022 aa16.59■□□□□ 0.25
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ATOH8Q96SQ7 321 aa16.57■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRRX2Q99811 253 aa16.57■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC12A9Q9BXP2 914 aa16.57■□□□□ 0.24
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM74BQ9NUR3 256 aa16.57■□□□□ 0.24
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TOP3BP1-201ENST00000420768 COPG2Q9UBF2 871 aa16.57■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa16.57■□□□□ 0.24
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUMA1Q14980 2115 aa16.57■□□□□ 0.24
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TOP3BP1-201ENST00000420768 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 SBK3P0C264 359 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 TPBGLP0DKB5 382 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYL2P10916 166 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 CPA3P15088 417 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 ACADLP28330 430 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 SERPINB4P48594 390 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 WDR4P57081 412 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP16.56■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 IRX4P78413 519 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABRQ12979 859 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP1R3AQ16821 1122 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 SBSNQ6UWP8 590 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 UNC5DQ6UXZ4 953 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZYG11AQ6WRX3 759 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 FRA10AC1Q70Z53 315 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPSM1Q86YR5 675 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 MGARPQ8TDB4 240 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC126Q96EE4 140 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIM54Q9BYV2 358 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 PARVBQ9HBI1 364 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLF15Q9UIH9 416 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 IKZF3Q9UKT9 509 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 OARD1Q9Y530 152 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 ST14Q9Y5Y6 855 aa16.56■□□□□ 0.24
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