RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414069.2

SPRN-201, Transcript of shadow of prion protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPRN, Length 3,128 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRN-201ENST00000414069 E2F3O00716 465 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 TEX28O15482 410 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 HOXA2O43364 376 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 CHEK2O96017 543 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 MILR1Q7Z6M3 343 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 OR4F6Q8NGB9 312 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 OSBPL10Q9BXB5 764 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 EHD1Q9H4M9 534 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 ASPDHA6ND91 283 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 URODP06132 367 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 RPS17P08708 135 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 COL6A1P12109 1028 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 ZNF23P17027 643 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 HNF1BP35680 557 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 PTGR1Q14914 329 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 CHRNA6Q15825 494 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 CYP51A1Q16850 503 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 ALG1LQ6GMV1 187 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 GPR141Q7Z602 305 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 GALNT7Q86SF2 657 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 CCDC154A6NI56 674 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 SH3BGRLO75368 114 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 ESRRBO95718 433 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 GNAO1P09471 354 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 G6PDP11413 515 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 ATP6V0D1P61421 351 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 BCL2L1Q07817 233 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 ADRM1Q16186 407 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 TRIM16LQ309B1 348 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 OTOP2Q7RTS6 562 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 OR56A4Q8NGH8 313 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 SLC22A17Q8WUG5 538 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 BORCS5Q969J3 196 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 IPPKQ9H8X2 491 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 INSL5Q9Y5Q6 135 aa20.47■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 REV3LO60673 3130 aa20.46■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 ARPC4P59998 168 aa20.46■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 ARHGEF7Q14155 803 aa20.46■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 ABRAXAS2Q15018 415 aa20.46■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 KCNJ8Q15842 424 aa20.46■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 GAREM2Q75VX8 874 aa20.46■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 SLC22A15Q8IZD6 547 aa20.46■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 DLG3Q92796 817 aa20.46■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 PYCR2Q96C36 320 aa20.46■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 IL26Q9NPH9 171 aa20.46■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa20.46■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 UPK3BL1B0FP48 263 aa20.46■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 UPK3BL2E5RIL1 263 aa20.46■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 FGF4P08620 206 aa20.46■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 SMARCB1Q12824 385 aa20.46■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 IKBKEQ14164 716 aa20.46■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 INAQ16352 499 aa20.46■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 BCL2A1Q16548 175 aa20.46■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 C6orf136Q5SQH8 315 aa20.46■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 Q6ZSR9 355 aa20.46■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 CBR4Q8N4T8 237 aa20.46■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 TMEM175Q9BSA9 504 aa20.46■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa20.46■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa20.46■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 GPR45Q9Y5Y3 372 aa20.46■□□□□ 0.87
SPRN-201ENST00000414069 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SPRN-201ENST00000414069 SOD2P04179 222 aa20.45■□□□□ 0.86
SPRN-201ENST00000414069 CLCN7P51798 805 aa20.45■□□□□ 0.86
SPRN-201ENST00000414069 EPHB3P54753 998 aa20.45■□□□□ 0.86
SPRN-201ENST00000414069 TNK2Q07912 1038 aa20.45■□□□□ 0.86
SPRN-201ENST00000414069 C5orf22Q49AR2 442 aa20.45■□□□□ 0.86
SPRN-201ENST00000414069 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SPRN-201ENST00000414069 DGKKQ5KSL6 1271 aa20.45■□□□□ 0.86
SPRN-201ENST00000414069 DEPDC1Q5TB30 811 aa20.45■□□□□ 0.86
SPRN-201ENST00000414069 SFRP1Q8N474 314 aa20.45■□□□□ 0.86
SPRN-201ENST00000414069 PBXIP1Q96AQ6 731 aa20.45■□□□□ 0.86
SPRN-201ENST00000414069 TAMM41Q96BW9 452 aa20.45■□□□□ 0.86
SPRN-201ENST00000414069 CEP295NLQ96MC4 621 aa20.45■□□□□ 0.86
SPRN-201ENST00000414069 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SPRN-201ENST00000414069 CCL26Q9Y258 94 aa20.45■□□□□ 0.86
SPRN-201ENST00000414069 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SPRN-201ENST00000414069 SLC22A3O75751 556 aa20.45■□□□□ 0.86
SPRN-201ENST00000414069 S100A1P23297 94 aa20.45■□□□□ 0.86
SPRN-201ENST00000414069 RPL38P63173 70 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SPRN-201ENST00000414069 LMAN2Q12907 356 aa20.45■□□□□ 0.86
SPRN-201ENST00000414069 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa20.45■□□□□ 0.86
SPRN-201ENST00000414069 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa20.45■□□□□ 0.86
SPRN-201ENST00000414069 ZNF366Q8N895 744 aa20.45■□□□□ 0.86
SPRN-201ENST00000414069 SLAIN1Q8ND83 568 aa20.45■□□□□ 0.86
SPRN-201ENST00000414069 ADCY4Q8NFM4 1077 aa20.45■□□□□ 0.86
SPRN-201ENST00000414069 OR2T34Q8NGX1 318 aa20.45■□□□□ 0.86
SPRN-201ENST00000414069 OR2T3Q8NH03 318 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms