RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413409.6

PTPRC-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-206ENST00000413409 ALG9Q9H6U8 611 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 MRGBPQ9NV56 204 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 TAS2R1Q9NYW7 299 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 CDYLQ9Y232 598 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 AK5Q9Y6K8 562 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 A0A0J9YYE9 177 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 PRRT4C9JH25 899 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 K7ERQ8 282 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 MAGEC1O60732 1142 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 KERAO60938 352 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 VPS26AO75436 327 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 TRBC1P01850 177 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 ESR1P03372 595 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 PKMP14618 531 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 NAA20P61599 178 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 XIAPP98170 497 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 RAD51Q06609 339 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 KIF19Q2TAC6 998 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 SH2D4BQ5SQS7 431 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 C22orf39Q6P5X5 142 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 TPGS1Q6ZTW0 290 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 TMEM25Q86YD3 366 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 CFAP61Q8NHU2 1237 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 KCNJ9Q92806 393 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 BHMTQ93088 406 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 MCUR1Q96AQ8 359 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 PTERQ96BW5 349 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 OTUB2Q96DC9 234 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 CMTM5Q96DZ9 223 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 SMIM14Q96QK8 99 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 LYSMD1Q96S90 227 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 GPR63Q9BZJ6 419 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 TBC1D14Q9P2M4 693 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 CLEC4EQ9ULY5 219 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 TMCO1Q9UM00 188 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 MED16Q9Y2X0 877 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 SNX11Q9Y5W9 270 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 NEMP2A6NFY4 417 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 A8MUI8 341 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 METTL12A8MUP2 240 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 B2RBV5 119 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 ZBTB14O43829 449 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 PRSS56P0CW18 603 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 TPBGLP0DKB5 382 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 SRCP12931 536 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 JUPP14923 745 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 IMPDH1P20839 514 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 CCND1P24385 295 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 CCR10P46092 362 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 RAP1GDS1P52306 607 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 SULT2A1Q06520 285 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 RTP5Q14D33 572 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 CAMK1DQ8IU85 385 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 PIANPQ8IYJ0 282 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 CADM4Q8NFZ8 388 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 KIAA1191Q96A73 305 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 BIRC8Q96P09 236 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 ATOH8Q96SQ7 321 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 GSTO2Q9H4Y5 243 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 ZNF385DQ9H6B1 395 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 ITM2CQ9NQX7 267 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 PLK2Q9NYY3 685 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 MARK1Q9P0L2 795 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 SLC25A13Q9UJS0 675 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-206ENST00000413409 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRC-206ENST00000413409 A0A1W2PQ67 120 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRC-206ENST00000413409 GOLGA8OA6NCC3 632 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRC-206ENST00000413409 GOLGA8NF8WBI6 632 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRC-206ENST00000413409 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP16.83■□□□□ 0.282e-7■■■□□ 15.8
PTPRC-206ENST00000413409 HLA-FP30511 346 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRC-206ENST00000413409 FMO4P31512 558 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRC-206ENST00000413409 GRK6P43250 576 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRC-206ENST00000413409 COPAP53621 1224 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRC-206ENST00000413409 INHBCP55103 352 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRC-206ENST00000413409 HERVK_113P63132 956 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRC-206ENST00000413409 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP16.83■□□□□ 0.28
PTPRC-206ENST00000413409 LY6DQ14210 128 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRC-206ENST00000413409 NAA25Q14CX7 972 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRC-206ENST00000413409 HERC3Q15034 1050 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRC-206ENST00000413409 FUT11Q495W5 492 aa16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms