RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATP5DP30049 168 aa8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CASQ1P31415 396 aa8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ABCG1P45844 678 aa8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VPS41P49754 854 aa8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRKAA1Q13131 559 aa8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRT33BQ14525 404 aa8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CLCA4Q14CN2 919 aa8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLCL1Q15111 1095 aa8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CASC4Q6P4E1 433 aa8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRUNE1Q86TP1 453 aa8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CFAP206Q8IYR0 622 aa8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TBC1D21Q8IYX1 336 aa8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PDIK1LQ8N165 341 aa8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GSDMBQ8TAX9 411 aa8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCNE4Q8WWG9 221 aa8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NCSTNQ92542 709 aa8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ELMO1Q92556 727 aa8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C9orf72Q96LT7 481 aa8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RMDN2Q96LZ7 410 aa8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TAAR9Q96RI9 348 aa8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM167BQ9BTA0 163 aa8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WWP1Q9H0M0 922 aa8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RDH14Q9HBH5 336 aa8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SYTL2Q9HCH5 934 aa8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FBXO8Q9NRD0 319 aa8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SYBUQ9NX95 663 aa8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KLHL42Q9P2K6 505 aa8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WDR37Q9Y2I8 494 aa8.37□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC5A10A0PJK1 596 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR5K3A6NET4 321 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM187AA6NFU0 413 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TLCD2A6NGC4 264 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STMND1H3BQB6 276 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAP3K7O43318 606 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VAPBO95292 243 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FKBP9O95302 570 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LIPCP11150 499 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PGAM1P18669 254 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SHMT2P34897 504 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CA5AP35218 305 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CBLBQ13191 982 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TUBB2AQ13885 445 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C16orf72Q14CZ0 275 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LONRF1Q17RB8 773 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DCAF12Q5T6F0 453 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NEPROQ6NW34 567 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARMC6Q6NXE6 501 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UNC5DQ6UXZ4 953 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CEACAM20Q6UY09 585 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIAA0408Q6ZU52 694 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 USP53Q70EK8 1073 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GALNT7Q86SF2 657 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MARCH9Q86YJ5 346 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 JAMLQ86YT9 394 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CILP2Q8IUL8 1156 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC22A15Q8IZD6 547 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CLDN19Q8N6F1 224 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OTUD6BQ8N6M0 293 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR8K5Q8NH50 307 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MFSD3Q96ES6 412 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SNF8Q96H20 258 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CAPZA3Q96KX2 299 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF778Q96MU6 729 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FCRL4Q96PJ5 515 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TUBB2BQ9BVA1 445 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM117AQ9C073 453 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 P2RY12Q9H244 342 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SEMA6CQ9H3T2 930 aa8.36□□□□□ -1.07
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms