RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 HIC2Q96JB3 615 aa23.39■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 SMOXQ9NWM0 555 aa23.39■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa23.38■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 LINC01553A4QN01 128 aa23.38■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 PDLIM1O00151 329 aa23.38■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 OLFM2O95897 454 aa23.38■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 ASLP04424 464 aa23.38■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 TRAF3Q13114 568 aa23.38■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 SULT1C3Q6IMI6 304 aa23.38■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 CYP20A1Q6UW02 462 aa23.38■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 CCDC115Q96NT0 180 aa23.38■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 BDH2Q9BUT1 245 aa23.38■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 C1orf50Q9BV19 199 aa23.38■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 PBX4Q9BYU1 374 aa23.38■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 CIPCQ9C0C6 399 aa23.38■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa23.38■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 CCL27Q9Y4X3 112 aa23.38■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 SLC28A1O00337 649 aa23.37■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 GREM1O60565 184 aa23.37■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 TRBC1P01850 177 aa23.37■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 CA3P07451 260 aa23.37■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 CDH1P12830 882 aa23.37■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 YBX1P67809 324 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 PLD1Q13393 1074 aa23.37■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 MILR1Q7Z6M3 343 aa23.37■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 BPIFB1Q8TDL5 484 aa23.37■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 BIRC7Q96CA5 298 aa23.37■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 IPPKQ9H8X2 491 aa23.37■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 OAZ3Q9UMX2 235 aa23.37■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa23.37■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa23.37■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 CCDC160A6NGH7 325 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 RGS14O43566 566 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 PRAMEF1O95521 474 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 HMOX2P30519 316 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 NFATC2Q13469 925 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 RAB33AQ14088 237 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 SCIMPQ6UWF3 145 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 OR52E4Q8NGH9 312 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 DNAJB8Q8NHS0 232 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 ESAMQ96AP7 390 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 NSMCE2Q96MF7 247 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 CGREF1Q99674 301 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 NTMT1Q9BV86 223 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 ACTL8Q9H568 366 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 H0YAE9 185 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 PRSS23O95084 383 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 CBSLP0DN79 551 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 HRH2P25021 359 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 ACRV1P26436 265 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 CBSP35520 551 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 CSKP41240 450 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 PIK3CGP48736 1102 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 BCL2L1Q07817 233 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 KIAA0040Q15053 153 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 NR6A1Q15406 480 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 CDKN3Q16667 212 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 AP5B1Q2VPB7 878 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 MPP7Q5T2T1 576 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 TRIM46Q7Z4K8 759 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 RIMKLAQ8IXN7 391 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 SLC39A11Q8N1S5 342 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 FAM110BQ8TC76 370 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 LYSMD1Q96S90 227 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 CD244Q9BZW8 370 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 TRPS1Q9UHF7 1281 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 ZNF510Q9Y2H8 683 aa23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 AGAP14A8MT82 685 aa23.35■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 IQCF5A8MTL0 148 aa23.35■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 PLOD2O00469 737 aa23.35■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 PRAMEF12O95522 483 aa23.35■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 G6PDP11413 515 aa23.35■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 VARSP26640 1264 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 TTKP33981 857 aa23.35■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 CAPGP40121 348 aa23.35■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 CDH18Q13634 790 aa23.35■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 GPRC6AQ5T6X5 926 aa23.35■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 GRAMD4Q6IC98 578 aa23.35■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
PMS1-205ENST00000409985 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
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