RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 GCNAQ96QF7 691 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 FCRL5Q96RD9 977 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 SMC6Q96SB8 1091 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 MAGEB5Q9BZ81 275 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 IL22Q9GZX6 179 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 SIK2Q9H0K1 926 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 OR10A5Q9H207 317 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CASS4Q9NQ75 786 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 TMEM74BQ9NUR3 256 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 MKS1Q9NXB0 559 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 GTSE1Q9NYZ3 720 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 SAMD15Q9P1V8 674 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 STOML2Q9UJZ1 356 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 VANGL2Q9ULK5 521 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 SNX10Q9Y5X0 201 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ITPR2Q14571 2701 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 A0A0G2JNJ9 132 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 A0A1B0GVM2 712 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 TMEM120BA0PK00 339 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 FAM47DPA6NHR8 397 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 SDR42E2A6NKP2 422 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 FAM159BA6NKW6 160 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 HEPACAM2A8MVW5 462 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 COCHO43405 550 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ACSL4O60488 711 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CLDN11O75508 207 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 NEBLO76041 1014 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 USP1O94782 785 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ZWINTO95229 277 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 SEC24AO95486 1093 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 FGF19O95750 216 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 FAM107AO95990 144 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 C1QAP02745 245 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 HLA-DQB2P05538 268 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 C1SP09871 688 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CCNB1P14635 433 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 BRAFP15056 766 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CHN1P15882 459 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CDC25CP30307 473 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 RENBPP51606 427 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CDH4P55283 916 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 DGCR2P98153 550 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CD83Q01151 205 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 IL10RBQ08334 325 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 TWF1Q12792 350 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 MPP3Q13368 585 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CRYMQ14894 314 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.362e-6■■□□□ 12.7
CCL20-202ENST00000409189 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 TM4SF20Q53R12 229 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 LGSNQ5TDP6 509 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 FBXL22Q6P050 247 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ZNF783Q6ZMS7 281 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 PID1Q7Z2X4 250 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 C14orf80Q86SX3 495 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 EXOC3L1Q86VI1 746 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 SLC26A11Q86WA9 606 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 LRRC6Q86X45 466 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 MFSD6LQ8IWD5 586 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ELMOD1Q8N336 334 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 BBS5Q8N3I7 341 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CCDC33Q8N5R6 958 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 LEMD2Q8NC56 503 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 DCAKDQ8WVC6 231 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 SMARCD2Q92925 531 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ZBTB9Q96C00 473 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CFAP36Q96G28 342 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 APOPT1Q96IL0 206 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 AGAP3Q96P47 875 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 SLC39A8Q9C0K1 460 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 NELFAQ9H3P2 528 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 SYBUQ9NX95 663 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 BFARQ9NZS9 450 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 Q9UFV3 132 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 SLC8A2Q9UPR5 921 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms