RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000406859.7

NRXN1-211, Transcript of neurexin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NRXN1, Length 2,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1-211ENST00000406859 FAM20BO75063 409 aa7.12□□□□□ -1.27
NRXN1-211ENST00000406859 FTH1P02794 183 aa7.12□□□□□ -1.27
NRXN1-211ENST00000406859 RETP07949 1114 aa7.12□□□□□ -1.27
NRXN1-211ENST00000406859 ALOX12P18054 663 aa7.12□□□□□ -1.27
NRXN1-211ENST00000406859 FDXRP22570 491 aa7.12□□□□□ -1.27
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NRXN1-211ENST00000406859 GMPPBQ9Y5P6 360 aa7.11□□□□□ -1.27
NRXN1-211ENST00000406859 NUP205Q92621 2012 aa7.11□□□□□ -1.27
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NRXN1-211ENST00000406859 PIRO00625 290 aa7.11□□□□□ -1.27
NRXN1-211ENST00000406859 TREHO43280 583 aa7.11□□□□□ -1.27
NRXN1-211ENST00000406859 GLP2RO95838 553 aa7.11□□□□□ -1.27
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