RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 MED13LQ71F56 2210 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 MYBL1P10243 752 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 HLA-DPA1P20036 260 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 SSR1P43307 286 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 ASIC2Q16515 512 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 CPNE8Q86YQ8 564 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 PQLC3Q8N755 202 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM11Q96F44 468 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 ISCUQ9H1K1 167 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 NUP62CLQ9H1M0 184 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 MYO6Q9UM54 1294 aa18.69■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1W2PQJ5 194 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 HBQ1P09105 142 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 PVRP15151 417 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 MX2P20592 715 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 PTGER4P35408 488 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 GJC1P36383 396 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 CDC16Q13042 620 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 SLC9A5Q14940 896 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 IGFL2Q6UWQ7 119 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 SPATA22Q8NHS9 363 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 NAT14Q8WUY8 206 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 RELTQ969Z4 430 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 TADA1Q96BN2 335 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 CBX8Q9HC52 389 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 FAM8A1Q9UBU6 413 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 IP6K2Q9UHH9 426 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 ANAPC7Q9UJX3 599 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 CDYLQ9Y232 598 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 NF1P21359 2839 aa18.68■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC78A2IDD5 438 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 GSAPA4D1B5 854 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC10BA6NIK2 292 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 BTN3A3O00478 584 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 ALOX12BO75342 701 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 UMODP07911 640 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 CYP2A13Q16696 494 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 LDLRAP1Q5SW96 308 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 FNBP1LQ5T0N5 605 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 GPRC6AQ5T6X5 926 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 DET1Q7L5Y6 550 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 NT5DC3Q86UY8 548 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 PARP9Q8IXQ6 854 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 KCTD6Q8NC69 237 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 DDHD1Q8NEL9 900 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 OR2Y1Q8NGV0 311 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 PTERQ96BW5 349 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 RMDN2Q96LZ7 410 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 AGAP3Q96P47 875 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 GBP5Q96PP8 586 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 SLX1AQ9BQ83 275 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 C17orf62Q9BQA9 187 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF670Q9BS34 389 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 PITPNM3Q9BZ71 974 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 ITPR3Q14573 2671 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 DCHS2Q6V1P9 2916 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 PCM1Q15154 2024 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 NUP210LQ5VU65 1888 aa18.67■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 DOCK10Q96BY6 2186 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 SVILO95425 2214 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 MGAT4DA6NG13 374 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 JRKO75564 520 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 NDST3O95803 873 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 SKILP12757 684 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 HMGCLP35914 325 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 GSE1Q14687 1217 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 NOMO1Q15155 1222 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 FAM151BQ6UXP7 276 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 FAF2Q96CS3 445 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 CNDP1Q96KN2 507 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 THAP2Q9H0W7 228 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 SLC25A51Q9H1U9 297 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 FAM60AQ9NP50 221 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 NDOR1Q9UHB4 597 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 ACSL5Q9ULC5 683 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa18.66■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 MYO7BQ6PIF6 2116 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC66A2RUB6 948 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 H3BMH7 237 aa18.65■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 AGPSO00116 658 aa18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms