RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400183.6

USP25-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-204ENST00000400183 CDH12P55289 794 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 HAVCR1Q96D42 359 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 DPEP2Q9H4A9 486 aa18.26■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 RYKP34925 604 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 IDH3AP50213 366 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 RPS14P62263 151 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 ABATP80404 500 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 ING5Q8WYH8 240 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 PI15O43692 258 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 LDLRAP1Q5SW96 308 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 HPS1Q92902 700 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 TLCD1Q96CP7 247 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 ART5Q96L15 291 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 TAPBPLQ9BX59 468 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 DIRAS2Q96HU8 199 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 ABCB9Q9NP78 766 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 FETUBQ9UGM5 382 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 COQ4Q9Y3A0 265 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 TRMUO75648 421 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 S100A9P06702 114 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 C8AP07357 584 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 CCR10P46092 362 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 SLC13A3Q8WWT9 602 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 CLEC4AQ9UMR7 237 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 FOXO6A8MYZ6 492 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 ENPP3O14638 875 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 NME6O75414 186 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 RBBP4Q09028 425 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 DPYSL2Q16555 572 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 IFI44LQ53G44 452 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 FAM129CQ86XR2 697 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 BANPQ8N9N5 519 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 KAT2AQ92830 837 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 AZIN2Q96A70 460 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 PTPN18Q99952 460 aa18.25■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 ACADLP28330 430 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 ASPAP45381 313 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 ARMCX6Q7L4S7 300 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 AKAP14Q86UN6 197 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 MTMR14Q8NCE2 650 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 HAPLN3Q96S86 360 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 UNGP13051 313 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 ZNF460Q14592 562 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 DPY19L1Q2PZI1 675 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 LAPTM4BQ86VI4 370 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 TRIM2Q9C040 744 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 CXCR6O00574 342 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 RPL17P18621 184 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 FRRS1Q6ZNA5 592 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 NODALQ96S42 347 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 PPLO60437 1756 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 ZNF541Q9H0D2 1346 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 RHPN2P1A8MT19 583 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 SLC1A2P43004 574 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 GDF10P55107 478 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 ZNF311Q5JNZ3 666 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 VITQ6UXI7 678 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 KREMEN2Q8NCW0 462 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 FCRL5Q96RD9 977 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 CLCC1Q96S66 551 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 TESMINQ9Y4I5 508 aa18.24■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 PEX10O60683 326 aa18.23■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 VARSP26640 1264 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 RPS6KA3P51812 740 aa18.23■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa18.23■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 PRKAB1Q9Y478 270 aa18.23■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 NEURL4Q96JN8 1562 aa18.23■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 CCNFP41002 786 aa18.23■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 DLG1Q12959 904 aa18.23■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 DNAJB8Q8NHS0 232 aa18.23■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 LRTOMTQ8WZ04 291 aa18.23■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 NTAN1Q96AB6 310 aa18.23■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 CDH7Q9ULB5 785 aa18.23■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 SAGE2PA6NJ88 616 aa18.23■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 P2RY8Q86VZ1 359 aa18.23■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 PDPRQ8NCN5 879 aa18.23■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 DBF4BQ8NFT6 615 aa18.23■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
USP25-204ENST00000400183 SMURF2Q9HAU4 748 aa18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms