RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398741.5

PRAME-201, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-201ENST00000398741 CIPCQ9C0C6 399 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 GKN1Q9NS71 199 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 TBC1D23Q9NUY8 699 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 LIMD1Q9UGP4 676 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ST14Q9Y5Y6 855 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 SH3PXD2BA1X283 911 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 UPK1AO00322 258 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 DFNA5O60443 496 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 STC2O76061 302 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 PRSS23O95084 383 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 CPNE6O95741 557 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 KLKB1P03952 638 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 CTPS1P17812 591 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 SHMT2P34897 504 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ACLYP53396 1101 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 MAPKAPK3Q16644 382 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 IMPG1Q17R60 797 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 CACHD1Q5VU97 1274 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 TTC23Q5W5X9 447 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 PDPRQ8NCN5 879 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ZNF555Q8NEP9 628 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 FAM162AQ96A26 154 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 GLT1D1Q96MS3 346 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ZNF583Q96ND8 569 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 TTPALQ9BTX7 342 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 DPY30Q9C005 99 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 GORASP2Q9H8Y8 452 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 FANCEQ9HB96 536 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 SMPD4Q9NXE4 827 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 WWOXQ9NZC7 414 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 VAPAQ9P0L0 249 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ADGRE2Q9UHX3 823 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 GNPTGQ9UJJ9 305 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ZNF840PA6NDX5 716 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 H0Y626 953 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 H0Y858 1186 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 SLC28A1O00337 649 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 FFAR3O14843 346 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 MAGEB3O15480 346 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 GPR42O15529 346 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 B4GAT1O43505 415 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 TBC1D4O60343 1298 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 GLUD1P00367 558 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 CST1P01037 141 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 COL6A1P12109 1028 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 TCF3P15923 654 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 CYP4F3Q08477 520 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 EPS8Q12929 822 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 PTGR1Q14914 329 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 FGD3Q5JSP0 725 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ADGRF1Q5T601 910 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 FAM151BQ6UXP7 276 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 SERPINA9Q86WD7 417 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 CARNMT1Q8N4J0 409 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 OR10A6Q8NH74 314 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 SLC47A1Q96FL8 570 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 RDH12Q96NR8 316 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 SH3GL1Q99961 368 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 TOR3AQ9H497 397 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 CWH43Q9H720 699 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 HPS4Q9NQG7 708 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 TLR9Q9NR96 1032 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 HCSTQ9UBK5 93 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 OPTCQ9UBM4 332 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 DNAJB9Q9UBS3 223 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 THSD7BQ9C0I4 1608 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 C16orf96A6NNT2 1141 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 TRIM16O95361 564 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 PRAMEF1O95521 474 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 CCNA2P20248 432 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 DGKAP23743 735 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 HMGCLP35914 325 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 PIK3CGP48736 1102 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ARMC12Q5T9G4 340 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 SULT1C3Q6IMI6 304 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 FAM117BQ6P1L5 589 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ENPP6Q6UWR7 440 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 NECAB2Q7Z6G3 386 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 RBFAQ8N0V3 343 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 FBXO22Q8NEZ5 403 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 OR13F1Q8NGS4 319 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 OVCA2Q8WZ82 227 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 GTF2H4Q92759 462 aa12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms