RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366976.3

NSL1-201, Transcript of NSL1, MIS12 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NSL1, Length 722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1-201ENST00000366976 PRAMEP78395 509 aa15.17■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 BASP1P80723 227 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 LRRC6Q86X45 466 aa15.17■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 MCUQ8NE86 351 aa15.17■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 GRK7Q8WTQ7 553 aa15.17■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 ART4Q93070 314 aa15.17■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 SLC41A2Q96JW4 573 aa15.17■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 OSBPL9Q96SU4 736 aa15.17■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 TCF12Q99081 682 aa15.17■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 CARD6Q9BX69 1037 aa15.17■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 FAM96AQ9H5X1 160 aa15.17■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 OCIAD1Q9NX40 245 aa15.17■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa15.17■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 ANAPC5Q9UJX4 755 aa15.17■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 SNX12Q9UMY4 172 aa15.17■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa15.17■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 OR5K3A6NET4 321 aa15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 KPNA5O15131 536 aa15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 PFDN6O15212 129 aa15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 KDM1AO60341 852 aa15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 GOT2P00505 430 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 FGF5P12034 268 aa15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 TYRP1P17643 537 aa15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 MPSTP25325 297 aa15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 COILP38432 576 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 MAPK9P45984 424 aa15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 KCNJ1P48048 391 aa15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 ADARP55265 1226 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 CXADRP78310 365 aa15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 CCDC38Q502W7 563 aa15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 OOSP2Q86WS3 158 aa15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 CLDN19Q8N6F1 224 aa15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 OR8K5Q8NH50 307 aa15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 SLCO2A1Q92959 643 aa15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 NKD1Q969G9 470 aa15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 SYTL2Q9HCH5 934 aa15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 CHRAC1Q9NRG0 131 aa15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 FOXJ2Q9P0K8 574 aa15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 POLG2Q9UHN1 485 aa15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 PILRAQ9UKJ1 303 aa15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 PSMD13Q9UNM6 376 aa15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 NEU2Q9Y3R4 380 aa15.16■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 SLC5A10A0PJK1 596 aa15.15■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 TLCD2A6NGC4 264 aa15.15■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 CCL22O00626 93 aa15.15■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 ITGB2P05107 769 aa15.15■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 GFERP55789 205 aa15.15■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 KRT33BQ14525 404 aa15.15■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 KCNJ11Q14654 390 aa15.15■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP15.15■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 MANEAQ5SRI9 462 aa15.15■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 CACHD1Q5VU97 1274 aa15.15■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 ZNF534Q76KX8 674 aa15.15■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 FAM129CQ86XR2 697 aa15.15■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 TBC1D21Q8IYX1 336 aa15.15■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 GPR150Q8NGU9 434 aa15.15■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 OR6P1Q8NGX9 317 aa15.15■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 RSC1A1Q92681 617 aa15.15■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 RMDN2Q96LZ7 410 aa15.15■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 ZNF778Q96MU6 729 aa15.15■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 TGM7Q96PF1 710 aa15.15■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 TWSG1Q9GZX9 223 aa15.15■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa15.15■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 HRASLS2Q9NWW9 162 aa15.15■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 SOX13Q9UN79 622 aa15.15■□□□□ 0.02
NSL1-201ENST00000366976 A8MU76 341 aa15.14■□□□□ 0.01
NSL1-201ENST00000366976 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
NSL1-201ENST00000366976 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
NSL1-201ENST00000366976 EFSO43281 561 aa15.14■□□□□ 0.01
NSL1-201ENST00000366976 RECKO95980 971 aa15.14■□□□□ 0.01
NSL1-201ENST00000366976 KRT14P02533 472 aa15.14■□□□□ 0.01
NSL1-201ENST00000366976 POLBP06746 335 aa15.14■□□□□ 0.01
NSL1-201ENST00000366976 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP15.14■□□□□ 0.01
NSL1-201ENST00000366976 ACADLP28330 430 aa15.14■□□□□ 0.01
NSL1-201ENST00000366976 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
NSL1-201ENST00000366976 HSD11B2P80365 405 aa15.14■□□□□ 0.01
NSL1-201ENST00000366976 ACY1Q03154 408 aa15.14■□□□□ 0.01
NSL1-201ENST00000366976 ABHD18Q0P651 414 aa15.14■□□□□ 0.01
NSL1-201ENST00000366976 PRKAA1Q13131 559 aa15.14■□□□□ 0.01
NSL1-201ENST00000366976 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
NSL1-201ENST00000366976 PLCL1Q15111 1095 aa15.14■□□□□ 0.01
NSL1-201ENST00000366976 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
NSL1-201ENST00000366976 SNAP47Q5SQN1 464 aa15.14■□□□□ 0.01
NSL1-201ENST00000366976 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
NSL1-201ENST00000366976 ANKS6Q68DC2 871 aa15.14■□□□□ 0.01
NSL1-201ENST00000366976 MRNIPQ6NTE8 343 aa15.14■□□□□ 0.01
NSL1-201ENST00000366976 ARMC6Q6NXE6 501 aa15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms