RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 FNBP1LQ5T0N5 605 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 GCNT6Q5T4J0 391 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PIK3R6Q5UE93 754 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ATG9BQ674R7 924 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 IL31Q6EBC2 164 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SLC25A24Q6NUK1 477 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 C11orf74Q86VG3 221 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 LRRC57Q8N9N7 239 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 RHEBL1Q8TAI7 183 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 EXT2Q93063 718 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ISOC1Q96CN7 298 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 KCTD10Q9H3F6 313 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 MFSD1Q9H3U5 465 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TRIM36Q9NQ86 728 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF446Q9NWS9 450 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CLCA2Q9UQC9 943 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 FAM170AA1A519 330 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 EFCAB9A8MZ26 197 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 KAT7O95251 611 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 IFNW1P05000 195 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 FOSL1P15407 271 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SMSP52788 366 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TWF1Q12792 350 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 LDLRAP1Q5SW96 308 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 RPTNQ6XPR3 784 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 HSDL2Q6YN16 418 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 VSIG10LQ86VR7 867 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CBWD2Q8IUF1 395 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PHACTR4Q8IZ21 702 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 KLHL36Q8N4N3 616 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 BANPQ8N9N5 519 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 FNDC11Q9BVV2 318 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SLC4A5Q9BY07 1137 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 DDIT4Q9NX09 232 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PLCL2Q9UPR0 1127 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CNTN6Q9UQ52 1028 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ANK1P16157 1881 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 M0QYT0 321 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 FZD9O00144 591 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 RASAL1O95294 804 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PIGRP01833 764 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 IFNA6P05013 189 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ERVK-10P10266 1014 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CDC25AP30304 524 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CNTN2Q02246 1040 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 DSG2Q14126 1118 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 IQCCQ4KMZ1 466 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PTCHD4Q6ZW05 846 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 MTMR8Q96EF0 704 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ARHGEF4Q9NR80 690 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ALG5Q9Y673 324 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 H3BN98 237 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 IFNA10P01566 189 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 IFNA4P05014 189 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 IST1P53990 364 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 RHBDL3P58872 404 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 MYBPC1Q00872 1141 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 RHDQ02161 417 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 DLG2Q15700 870 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 C10orf120Q5SQS8 335 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 C1orf186Q6ZWK4 172 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TMPRSS11BQ86T26 416 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 LRRC71Q8N4P6 559 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 RXFP2Q8WXD0 754 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SLC22A18Q96BI1 424 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ELMO3Q96BJ8 720 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF597Q96LX8 424 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 RANBP9Q96S59 729 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 MYOCQ99972 504 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 RNPEPQ9H4A4 650 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 MGAT4BQ9UQ53 548 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CNTNAP1P78357 1384 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 AP5Z1O43299 807 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 AP2A2O94973 939 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PRAMEF1O95521 474 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 LATS1O95835 1130 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 LCP1P13796 627 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 KIR3DL1P43629 444 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CACNG1Q06432 222 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 NEDD8Q15843 81 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ZACNQ401N2 412 aa4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms