RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335658.6

DPPA4-201, Transcript of developmental pluripotency associated 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene DPPA4, Length 2,817 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPPA4-201ENST00000335658 PRKAA1Q13131 559 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 CCNIQ14094 377 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 PTPRRQ15256 657 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 HECTD2Q5U5R9 776 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 CLEC6AQ6EIG7 209 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 ZNF765Q7L2R6 523 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 NRSN1Q8IZ57 195 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 ZBTB44Q8NCP5 570 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 FAM156AQ8NDB6 213 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 OR13C4Q8NGS5 318 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 OR13J1Q8NGT2 312 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 OR6Y1Q8NGX8 325 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 GAB3Q8WWW8 586 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 GPR78Q96P69 363 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 NPAS2Q99743 824 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 FAM96AQ9H5X1 160 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 INIPQ9NRY2 104 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 XPAP23025 273 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 TEAD1P28347 426 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 HADHAP40939 763 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 DPP6P42658 865 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 ADPRHP54922 357 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 CDH13P55290 713 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 RALGDSQ12967 914 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 LSAMPQ13449 338 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 PPP1R3AQ16821 1122 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 LAYNQ6UX15 382 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 CYP2U1Q7Z449 544 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 FAM174AQ8TBP5 190 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 NAT14Q8WUY8 206 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 LZICQ8WZA0 190 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 CDRT15Q96T59 188 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 LRFN3Q9BTN0 628 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 FAM192AQ9GZU8 254 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 BTBD1Q9H0C5 482 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 PCDH12Q9NPG4 1184 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 CIDEBQ9UHD4 219 aa7.13□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 CEP192Q8TEP8 1941 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 A0A1W2PP55 124 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 LRRC14BA6NHZ5 514 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 TXNDC9O14530 226 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 TOR1BO14657 336 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 SUPT7LO94864 414 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 ZCCHC18P0CG32 403 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 VARSP26640 1264 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 HOXD12P35452 270 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 HNF1BP35680 557 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 RPS21P63220 83 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 ANGPT1Q15389 498 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 FAM83EQ2M2I3 478 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 TMEM259Q4ZIN3 620 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 GK5Q6ZS86 529 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 CNTN4Q8IWV2 1026 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 PGBD3Q8N328 593 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 LPCAT1Q8NF37 534 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 BRSK1Q8TDC3 778 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 RMDN1Q96DB5 314 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 HIC2Q96JB3 615 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 GBP5Q96PP8 586 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 SPATA16Q9BXB7 569 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 SLC6A17Q9H1V8 727 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 S100A14Q9HCY8 104 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 DMTF1Q9Y222 760 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 POMPQ9Y244 141 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 SH3GLB1Q9Y371 365 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 LRRK1Q38SD2 2015 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 A0A087X1B8 175 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 FAM86C2PA6NEL3 165 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 A8MT66 165 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 C9JVG2 144 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 F8W8V4 182 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 LATO43561 262 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 SEMA4FO95754 770 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 GOT2P00505 430 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 ETS2P15036 469 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 PMLP29590 882 aa7.12□□□□□ -1.27
DPPA4-201ENST00000335658 KCNC1P48547 511 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 543 ms