RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331018.8

TTLL1-202, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTLL1, Length 1,185 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1-202ENST00000331018 CDKL2Q92772 493 aa11.96□□□□□ -0.49
TTLL1-202ENST00000331018 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
TTLL1-202ENST00000331018 LYSMD1Q96S90 227 aa11.96□□□□□ -0.49
TTLL1-202ENST00000331018 NAT9Q9BTE0 207 aa11.96□□□□□ -0.49
TTLL1-202ENST00000331018 CCDC28BQ9BUN5 200 aa11.96□□□□□ -0.49
TTLL1-202ENST00000331018 TMEM168Q9H0V1 697 aa11.96□□□□□ -0.49
TTLL1-202ENST00000331018 ABCG8Q9H221 673 aa11.96□□□□□ -0.49
TTLL1-202ENST00000331018 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa11.96□□□□□ -0.49
TTLL1-202ENST00000331018 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
TTLL1-202ENST00000331018 SIRPGQ9P1W8 387 aa11.96□□□□□ -0.49
TTLL1-202ENST00000331018 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
TTLL1-202ENST00000331018 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
TTLL1-202ENST00000331018 GULP1Q9UBP9 304 aa11.96□□□□□ -0.49
TTLL1-202ENST00000331018 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
TTLL1-202ENST00000331018 TAGLN3Q9UI15 199 aa11.96□□□□□ -0.49
TTLL1-202ENST00000331018 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa11.96□□□□□ -0.49
TTLL1-202ENST00000331018 A0A0U1RQS6 177 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 PRSS38A1L453 326 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 CAPN8A6NHC0 703 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 A6NHS1 94 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 FAM159BA6NKW6 160 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 MAP3K7O43318 606 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 NOBOXO60393 691 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 GLRA3O75311 464 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 JCHAINP01591 159 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 MPOP05164 745 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 PNLIPP16233 465 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 ZNF30P17039 623 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 PGM1P36871 562 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 STC1P52823 247 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 PDX1P52945 283 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 CDK3Q00526 305 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 ZBTB17Q13105 803 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 RCN1Q15293 331 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 TCEA2Q15560 299 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 GSTA3Q16772 222 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 LRRC66Q68CR7 880 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 TAF8Q7Z7C8 310 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 PDZD3Q86UT5 571 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 NRROSQ86YC3 692 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 NUDCD3Q8IVD9 361 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 CCNYQ8ND76 341 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 CCL4L1Q8NHW4 92 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 CCDC74AQ96AQ1 378 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 SPDL1Q96EA4 605 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 HIC2Q96JB3 615 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 OLFM3Q96PB7 478 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 LGMNQ99538 433 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 MIPEPQ99797 713 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 GPAMQ9HCL2 828 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 CYP4F12Q9HCS2 524 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 APPL1Q9UKG1 709 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 ASXL3Q9C0F0 2248 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 FAM208BQ5VWN6 2430 aa11.95□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 ACACAQ13085 2346 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 URB1O60287 2271 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 A0A1W2PQM1 296 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 KCNK1O00180 336 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 GLB1P16278 677 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 ITPKBP27987 946 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 MAGEA3P43357 314 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 ERVPABLB-1P60509 514 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 GABREP78334 506 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 AP1B1Q10567 949 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 STX3Q13277 289 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 SEMA5AQ13591 1074 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 STEAP4Q687X5 459 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 NPNTQ6UXI9 565 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 IGDCC3Q8IVU1 814 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 SFTPA2Q8IWL1 248 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 NRSN1Q8IZ57 195 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 FAM46DQ8NEK8 389 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 ARMC2Q8NEN0 867 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 TADA1Q96BN2 335 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 DCBLD2Q96PD2 775 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 C1orf21Q9H246 121 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 VCX3BQ9H321 246 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 KCNK13Q9HB14 408 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 ASCL3Q9NQ33 180 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa11.94□□□□□ -0.5
TTLL1-202ENST00000331018 HEY1Q9Y5J3 304 aa11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms