RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 VCLP18206 1134 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST1H2ADP20671 130 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 MPSTP25325 297 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CCR7P32248 378 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 MAPK9P45984 424 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 GSTM4Q03013 218 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CLCQ05315 142 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 SGCGQ13326 291 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 GTF2H3Q13889 308 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT72Q14CN4 511 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 SH2D4BQ5SQS7 431 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 RAET1GQ6H3X3 334 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 SULT1C3Q6IMI6 304 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM220Q6QAJ8 160 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CYHR1Q6ZMK1 362 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 DET1Q7L5Y6 550 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CUZD1Q86UP6 607 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 TMPRSS6Q8IU80 811 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 AGR3Q8TD06 166 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 MCOLN3Q8TDD5 553 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 SKA1Q96BD8 255 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 NSL1Q96IY1 281 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST1H2AJQ99878 128 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CCM2Q9BSQ5 444 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 H2AFJQ9BTM1 129 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 RDH14Q9HBH5 336 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM39Q9HCM9 518 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 TCF7L2Q9NQB0 619 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 MRGBPQ9NV56 204 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC12A4Q9UP95 1085 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD65E5RJM6 399 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 H0YHG0 523 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 MAN2B1O00754 1011 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 INPP4BO15327 924 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC16A5O15375 505 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 FFAR2O15552 330 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 VEGFDO43915 354 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 NUAK1O60285 661 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 MTX2O75431 263 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 UNC5CO95185 931 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 EGFP01133 1207 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ANXA5P08758 320 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 MPC1LP0DKB6 136 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ARAFP10398 606 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 HOXB2P14652 356 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CCR3P51677 355 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 MNAT1P51948 309 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CDH13P55290 713 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS14P62263 151 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 LCP2Q13094 533 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC44A4Q53GD3 710 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 EOGTQ5NDL2 527 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM91A1Q658Y4 838 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ATG14Q6ZNE5 492 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 NEK10Q6ZWH5 1172 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 IL17RCQ8NAC3 791 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 OR56A4Q8NGH8 313 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CEP70Q8NHQ1 597 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ELMO1Q92556 727 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM159Q96B96 161 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 MOCOSQ96EN8 888 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 HIC2Q96JB3 615 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 EGFL8Q99944 293 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 EBF4Q9BQW3 602 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 HGH1Q9BTY7 390 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC28BQ9BUN5 200 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 GSTO2Q9H4Y5 243 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 PARVBQ9HBI1 364 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 MID1IP1Q9NPA3 183 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 ACSS2Q9NR19 701 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXL12Q9NXK8 326 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 IKZF3Q9UKT9 509 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CDYLQ9Y232 598 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 COQ6Q9Y2Z9 468 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 OARD1Q9Y530 152 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CHD9Q3L8U1 2897 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 CHD7Q9P2D1 2997 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 C2orf16Q68DN1 1984 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PP55 124 aa9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms