RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318121.7

CLSPN-202, Transcript of claspin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLSPN, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPN-202ENST00000318121 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 GMEB2Q9UKD1 530 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 PLLPQ9Y342 182 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 ANKRD33BA6NCL7 494 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 IQCF5A8MTL0 148 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 CLCNKAP51800 687 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 HK3P52790 923 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 B4GALNT1Q00973 533 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 TTMPQ5BVD1 217 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 MGARPQ8TDB4 240 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 LRRC8CQ8TDW0 803 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 SH3KBP1Q96B97 665 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 NXNL1Q96CM4 212 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 FAM111AQ96PZ2 611 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 MCMBPQ9BTE3 642 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 FGF22Q9HCT0 170 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 PFDN4Q9NQP4 134 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 NUDT4Q9NZJ9 180 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 SLC6A14Q9UN76 642 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 ASF1AQ9Y294 204 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 CA5BQ9Y2D0 317 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 THADAQ6YHU6 1953 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 LAMA3Q16787 3333 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 TMEM202A6NGA9 273 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 BIRC5O15392 142 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 PLIN3O60664 434 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 IPO13O94829 963 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 SLCO2B1O94956 709 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 GLRBP48167 497 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 PIK3CGP48736 1102 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 CLCN7P51798 805 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 IRX4P78413 519 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 DMPKQ09013 629 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 ABRQ12979 859 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 INAVAQ3KP66 663 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 ACSBG2Q5FVE4 666 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 PPM1JQ5JR12 505 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 KDM7AQ6ZMT4 941 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 CEP97Q8IW35 865 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 ARMC2Q8NEN0 867 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 MZB1Q8WU39 189 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 OR1E3Q8WZA6 343 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 EXT2Q93063 718 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 UBXN10Q96LJ8 280 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 ALG9Q9H6U8 611 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 MVB12BQ9H7P6 319 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 POLG2Q9UHN1 485 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 STK38LQ9Y2H1 464 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 CUL9Q8IWT3 2517 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 MYLKQ15746 1914 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 SLC5A10A0PJK1 596 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 TRIM13O60858 407 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 GPC4O75487 556 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 GRK2P25098 689 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 CCR7P32248 378 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 DMWDQ09019 674 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 WASH2PQ6VEQ5 465 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 PIM3Q86V86 326 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 FBXO39Q8N4B4 442 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 FRMD1Q8N878 549 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 ZBTB44Q8NCP5 570 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 LGR4Q9BXB1 951 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 PARVBQ9HBI1 364 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 WASH6PQ9NQA3 447 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 ARL15Q9NXU5 204 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 WWOXQ9NZC7 414 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 XPR1Q9UBH6 696 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 KCNK6Q9Y257 313 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 HMX2A2RU54 273 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 H0Y8X5 98 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 H3BQF6 201 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 KERAO60938 352 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 CER1O95813 267 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 TDGF1P13385 188 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 CD1DP15813 335 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 CHN1P15882 459 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 SERPINB4P48594 390 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 ATP1A2P50993 1020 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 NXPH1P58417 271 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 ZNF460Q14592 562 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSPN-202ENST00000318121 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms