RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 CATP04040 527 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SMIM18P0DKX4 95 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 IRF8Q02556 426 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ACVR1Q04771 509 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 DMC1Q14565 340 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PAGE2BQ5JRK9 111 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SLC2A7Q6PXP3 512 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ZNF621Q6ZSS3 439 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 FBXO22Q8NEZ5 403 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 OR4F6Q8NGB9 312 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SMPD4Q9NXE4 827 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 FLRT1Q9NZU1 646 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 GPR45Q9Y5Y3 372 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PARP14Q460N5 1801 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 LOC285556D6RIA3 1793 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 FAM220BPB1ANY3 271 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 TNFRSF10BO14763 440 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CA12O43570 354 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 GLUD1P00367 558 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 FABP3P05413 133 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 TFAP2AP05549 437 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PCNAP12004 261 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 HDCP19113 662 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CAPN3P20807 821 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 IGFBP5P24593 272 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 OR1D2P34982 312 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 TMED10P49755 219 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 MGAT3Q09327 533 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 FAM26DQ5JW98 314 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SPRED1Q7Z699 444 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CYP4Z1Q86W10 505 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 RASAL3Q86YV0 1011 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 OR10A6Q8NH74 314 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 UBE2E3Q969T4 207 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ACDQ96AP0 544 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SMOXQ9NWM0 555 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 AHSPQ9NZD4 102 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SLC13A4Q9UKG4 626 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PHF24Q9UPV7 400 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PTGES3LE9PB15 166 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 MANBAO00462 879 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 JUNP05412 331 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 GSNP06396 782 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 KCNA5P22460 613 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 KIR3DL1P43629 444 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 PGGT1BP53609 377 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ARSFP54793 590 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 DIO3P55073 304 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 MTPNP58546 118 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 RCAN2Q14206 197 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 RABL3Q5HYI8 236 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CRTC3Q6UUV7 619 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 C17orf99Q6UX52 265 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 MFSD6LQ8IWD5 586 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 OFCC1Q8IZS5 231 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 DPP10Q8N608 796 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 NODALQ96S42 347 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 HTATIP2Q9BUP3 242 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 DGCR6LQ9BY27 220 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CD244Q9BZW8 370 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 AURKAO14965 403 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 JAK1P23458 1154 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 GRK3P35626 688 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 KCNQ1P51787 676 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SP140Q13342 867 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 FOXB2Q5VYV0 432 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ADGRG5Q8IZF4 528 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 LRCH3Q96II8 777 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ZNF558Q96NG5 402 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 BCL7BQ9BQE9 202 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 BRINP2Q9C0B6 783 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ANKHQ9HCJ1 492 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 OSER1Q9NX31 292 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SPG21Q9NZD8 308 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 SGTAO43765 313 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 G6PDP11413 515 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-201ENST00000264345 GGT1P19440 569 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms