RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257818.2

LMO2-201, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 2,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-201ENST00000257818 HS3ST5Q8IZT8 346 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 NAT16Q8N8M0 369 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 MAGED4Q96JG8 741 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 SPO11Q9Y5K1 396 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 DGKBQ9Y6T7 804 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 G3V2T6 193 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 RAMP2O60895 175 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 EPOP01588 193 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 ERVPABLB-1P60509 514 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 CHRNB3Q05901 458 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 DUSP4Q13115 394 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 GPR17Q13304 367 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 SULT1C3Q6IMI6 304 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 TXNDC11Q6PKC3 985 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 ENPP6Q6UWR7 440 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 ZNF583Q96ND8 569 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 HEBP1Q9NRV9 189 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 TMEM45AQ9NWC5 275 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 SMPD4Q9NXE4 827 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 IL37Q9NZH6 218 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 SEPT3Q9UH03 358 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 RIMKLBQ9ULI2 386 aa24.31■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 NOBOXO60393 691 aa24.3■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 G6PDP11413 515 aa24.3■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 HTR1BP28222 390 aa24.3■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 HTR6P50406 440 aa24.3■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 PLIN5Q00G26 463 aa24.3■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 TAF10Q12962 218 aa24.3■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 MYEOVQ96EZ4 313 aa24.3■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 TRIB3Q96RU7 358 aa24.3■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 COMMD8Q9NX08 183 aa24.3■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 UTS2RQ9UKP6 389 aa24.3■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 ARNTLO00327 626 aa24.3■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 AXIN1O15169 862 aa24.3■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 FUT4P22083 530 aa24.3■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 RXRGP48443 463 aa24.3■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 TTC23Q5W5X9 447 aa24.3■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 LETMD1Q6P1Q0 360 aa24.3■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 PRR23BQ6ZRT6 265 aa24.3■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 MIB1Q86YT6 1006 aa24.3■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 HBEGFQ99075 208 aa24.3■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 OSBPL10Q9BXB5 764 aa24.3■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 PDE10AQ9Y233 779 aa24.3■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 ACTL7AQ9Y615 435 aa24.3■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 ANKRD28O15084 1053 aa24.29■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 HOXA2O43364 376 aa24.29■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 TBC1D4O60343 1298 aa24.29■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 XYLBO75191 536 aa24.29■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 AGXTP21549 392 aa24.29■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 PTPRNQ16849 979 aa24.29■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 CRTC3Q6UUV7 619 aa24.29■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.487e-7■■■■□ 22.4
LMO2-201ENST00000257818 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 GIPC2Q8TF65 315 aa24.29■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 MUL1Q969V5 352 aa24.29■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 NSMCE3Q96MG7 304 aa24.29■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 TTPALQ9BTX7 342 aa24.29■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 DGCR6LQ9BY27 220 aa24.29■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 NDUFS3O75489 264 aa24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 CCL5P13501 91 aa24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 PPP2R2BQ00005 443 aa24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 LAPTM5Q13571 262 aa24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 PWP1Q13610 501 aa24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 ZNF235Q14590 738 aa24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 CYP20A1Q6UW02 462 aa24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 PJA1Q8NG27 643 aa24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 OR4K2Q8NGD2 314 aa24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 FBXO30Q8TB52 745 aa24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 RDH12Q96NR8 316 aa24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 ZNF347Q96SE7 839 aa24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 ZNF382Q96SR6 550 aa24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 FEM1AQ9BSK4 669 aa24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 OGDHLQ9ULD0 1010 aa24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 ST14Q9Y5Y6 855 aa24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 FAM92AA1XBS5 289 aa24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 C16orf96A6NNT2 1141 aa24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 PRAMEF11O60813 436 aa24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 NIPSNAP2O75323 286 aa24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 HMBSP08397 361 aa24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 CD47Q08722 323 aa24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 FIG4Q92562 907 aa24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 SMIM14Q96QK8 99 aa24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 TMEM175Q9BSA9 504 aa24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 SAGE1Q9NXZ1 904 aa24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 VAPAQ9P0L0 249 aa24.28■■□□□ 1.48
LMO2-201ENST00000257818 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms