RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000185355.6

Ldb1-208, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 2,088 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Adam21Q9JI76 729 aa27.39■■□□□ 1.98
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gbp6A0A0G2JDV3 611 aa27.39■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Sec14l5B2RXM5 696 aa27.39■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ptpn5P54830 541 aa27.39■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ptchd3Q0EEE2 906 aa27.39■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Catsper3Q80W99 395 aa27.39■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Fam109aQ8BH49 266 aa27.39■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gjc2Q8BQU6 440 aa27.39■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Samd4aQ8CBY1 711 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Wdr74Q8VCG3 384 aa27.39■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Dennd2dQ91VV4 469 aa27.39■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Mta3Q924K8 591 aa27.39■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Tex19.1Q99MV2 351 aa27.39■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Aldh1a3Q9JHW9 512 aa27.39■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 AicdaQ9WVE0 198 aa27.39■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 KcpQ3U492 1550 aa27.38■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Armc4B2RY50 1037 aa27.38■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rnf169E9Q7F2 694 aa27.38■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Il4i1O09046 630 aa27.38■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Pdlim1O70400 327 aa27.38■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Fgf18O89101 207 aa27.38■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gstm1P10649 218 aa27.38■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Htr4P97288 388 aa27.38■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Emx2Q04744 253 aa27.38■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Hs3st2Q673U1 367 aa27.38■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gxylt2Q810K9 444 aa27.38■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Lair1Q8BG84 263 aa27.38■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Mtif2Q91YJ5 727 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Upf1Q9EPU0 1124 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 PtsQ9R1Z7 144 aa27.38■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Vmn2r54K7N649 806 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Cbx4O55187 551 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Hoxa4P06798 285 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Tcf3P15806 651 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 F2P19221 618 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Cd19P25918 547 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Il11ra2P70225 432 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Naf1Q3UMQ8 489 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 A630001G21RikQ3UTB2 229 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Pfdn4Q3UWL8 134 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 D3Ertd751eQ8BGN2 192 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Thoc5Q8BKT7 683 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gprc6aQ8K4Z6 928 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ntmt1Q8R2U4 223 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr1310Q8VF85 312 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Cyb5r1Q9DB73 305 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 EefsecQ9JHW4 583 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Asb3Q9WV72 525 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Psmd13Q9WVJ2 376 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Cd320Q9Z1P5 260 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr566A0A1B0GST0 319 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Vmn2r94E9PZK8 818 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Csf2rb2P26954 878 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr1036Q7TR85 310 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Dtd2Q8BHA3 168 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Lancl3Q8CD19 420 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Lsm1Q8VC85 133 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Mrgpra2Q91WW4 305 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Nudt7Q99P30 236 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ppil1Q9D0W5 166 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Akr1a1Q9JII6 325 aa27.37■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Zscan4bE9Q3G0 505 aa27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Il1rl1P14719 567 aa27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Eno2P17183 434 aa27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Upp1P52624 311 aa27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Lrig1P70193 1091 aa27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Tmem173Q3TBT3 378 aa27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 HecaQ3V1N5 544 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Syce1lQ5D525 247 aa27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 CcnhQ61458 323 aa27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Creb3Q61817 404 aa27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Pwwp2aQ69Z61 730 aa27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Fam189a1Q6A044 515 aa27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ranbp10Q6VN19 620 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 C2cd4bQ80XU5 340 aa27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ppp1r1cQ8BKK4 108 aa27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Trmt2bQ8BQJ6 493 aa27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr342Q8VGK7 312 aa27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 HnrnprQ8VHM5 632 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 PyglQ9ET01 850 aa27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rai2Q9QVY8 529 aa27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Phf11bB4XVQ1 276 aa27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Fkbp7O54998 218 aa27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Chrm1P12657 460 aa27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ybx1P62960 322 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Naa11Q3UX61 218 aa27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Tab3Q571K4 716 aa27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Nr6a1Q64249 495 aa27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rbms3Q8BWL5 431 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Capn8Q91VA3 703 aa27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Aim2Q91VJ1 354 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 TmlheQ91ZE0 421 aa27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Kif19Q99PT9 997 aa27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Nrf1Q9WU00 503 aa27.36■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 4930444G20RikD3Z741 495 aa27.35■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ceacam3E9Q6J4 706 aa27.35■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rnf165E9QAU8 347 aa27.35■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Dgcr6O35347 198 aa27.35■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 JunbP09450 344 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Slc2a3P32037 493 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45 ms