RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 OTOAQ7RTW8 1153 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 CMC1Q7Z7K0 106 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 PIM3Q86V86 326 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 CFAP206Q8IYR0 622 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 IQCKQ8N0W5 287 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 OR2I1PQ8NGU4 316 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 GIMAP7Q8NHV1 300 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 CCL4L1Q8NHW4 92 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 HM13Q8TCT9 377 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 GPBAR1Q8TDU6 330 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 LMX1AQ8TE12 382 aa8.36□□□□□ -1.07
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SGMS1-211ENST00000626236 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
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SGMS1-211ENST00000626236 TPP1O14773 563 aa8.35□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
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SGMS1-211ENST00000626236 SERPINB8P50452 374 aa8.35□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 RAB10P61026 200 aa8.35□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 GSTM4Q03013 218 aa8.35□□□□□ -1.07
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SGMS1-211ENST00000626236 CEP97Q8IW35 865 aa8.35□□□□□ -1.07
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SGMS1-211ENST00000626236 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
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SGMS1-211ENST00000626236 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 SLC5A10A0PJK1 596 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 LNP1A1A4G5 178 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 PDZK1P1A8MUH7 402 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 FOXO6A8MYZ6 492 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 PROB1E7EW31 1015 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 DYNC1I1O14576 645 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 YKT6O15498 198 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 FFAR2O15552 330 aa8.34□□□□□ -1.07
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