RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623449.3

CU633967.1-202, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CU633967.1, Length 560 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633967.1-202ENST00000623449 LDB2O43679 373 aa8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 STK17BO94768 372 aa8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 AP2A1O95782 977 aa8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 MSL3P1P0C860 447 aa8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 RALBP11234 206 aa8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 LIFP15018 202 aa8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 AMD1P17707 334 aa8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 ITGB6P18564 788 aa8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 ITGALP20701 1170 aa8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 DRG2P55039 364 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 MC1RQ01726 317 aa8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 RPA4Q13156 261 aa8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 LY6DQ14210 128 aa8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 NFE2L1Q14494 772 aa8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 TBR1Q16650 682 aa8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 BRICD5Q6PL45 260 aa8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 TMEM220Q6QAJ8 160 aa8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 KIAA1328Q86T90 577 aa8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 GAS2L3Q86XJ1 694 aa8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 CCDC110Q8TBZ0 833 aa8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 HM13Q8TCT9 377 aa8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 RSC1A1Q92681 617 aa8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 TSGA10Q9BZW7 698 aa8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 ASB8Q9H765 288 aa8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 FKBPLQ9UIM3 349 aa8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 RIMKLBQ9ULI2 386 aa8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 COL12A1Q99715 3063 aa8.6□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 MACROD2A1Z1Q3 448 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 OR5K3A6NET4 321 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 TLCD2A6NGC4 264 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 MROH6A6NGR9 719 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 OR2AG2A6NM03 316 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 A8MU76 341 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 MATN2O00339 956 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 AP2A2O94973 939 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 MT-ND3P03897 115 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 TYRP1P17643 537 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 ACRV1P26436 265 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 AKT1P31749 480 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 STIP1P31948 543 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 MAPK9P45984 424 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 CD151P48509 253 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 LAMB3Q13751 1172 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 OASLQ15646 514 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 SNAP47Q5SQN1 464 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 FNBP1LQ5T0N5 605 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 AADACL2Q6P093 401 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 BORAQ6PGQ7 559 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 PACS1Q6VY07 963 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 ZNF662Q6ZS27 426 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 LINC00523Q86TU6 105 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 D2HGDHQ8N465 521 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 OR13C4Q8NGS5 318 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 GPR150Q8NGU9 434 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 OR8K5Q8NH50 307 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 STYXQ8WUJ0 223 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 EXTL1Q92935 676 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 PEX13Q92968 403 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 SGSM3Q96HU1 749 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 TGM7Q96PF1 710 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 COPS8Q99627 209 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 TWSG1Q9GZX9 223 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 C10orf88Q9H8K7 445 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 VPS37BQ9H9H4 285 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 APMAPQ9HDC9 416 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 LATS2Q9NRM7 1088 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 CRLS1Q9UJA2 301 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 PTPN13Q12923 2485 aa8.59□□□□□ -1.03
CU633967.1-202ENST00000623449 LRRK2Q5S007 2527 aa8.58□□□□□ -1.04
CU633967.1-202ENST00000623449 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa8.58□□□□□ -1.04
CU633967.1-202ENST00000623449 C21orf140B9A014 251 aa8.58□□□□□ -1.04
CU633967.1-202ENST00000623449 F5H423 210 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CU633967.1-202ENST00000623449 J3QKU1 62 aa8.58□□□□□ -1.04
CU633967.1-202ENST00000623449 QSOX1O00391 747 aa8.58□□□□□ -1.04
CU633967.1-202ENST00000623449 BUD23O43709 281 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CU633967.1-202ENST00000623449 SUN1O94901 812 aa8.58□□□□□ -1.04
CU633967.1-202ENST00000623449 METTL18O95568 372 aa8.58□□□□□ -1.04
CU633967.1-202ENST00000623449 SLC35G4P0C7Q5 338 aa8.58□□□□□ -1.04
CU633967.1-202ENST00000623449 GSDMDP57764 484 aa8.58□□□□□ -1.04
CU633967.1-202ENST00000623449 ACY1Q03154 408 aa8.58□□□□□ -1.04
CU633967.1-202ENST00000623449 CACNG1Q06432 222 aa8.58□□□□□ -1.04
CU633967.1-202ENST00000623449 CDC20Q12834 499 aa8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms