RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622972.3

LINC00963-215, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00963, Length 444 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-215ENST00000622972 SLC7A5Q01650 507 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 DR1Q01658 176 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 PLAURQ03405 335 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 SEMA3AQ14563 771 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 POU6F1Q14863 301 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 TGIF1Q15583 401 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 TPSAB1Q15661 275 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ELOA3BQ3SY89 546 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 SNAP47Q5SQN1 464 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 FNBP1LQ5T0N5 605 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ALS2CLQ60I27 953 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 DUPD1Q68J44 220 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 OGFOD3Q6PK18 319 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 CES3Q6UWW8 571 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 VASH2Q86V25 355 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ZFAND4Q86XD8 727 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 FAM129CQ86XR2 697 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 GALNT13Q8IUC8 556 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 NRSN1Q8IZ57 195 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 UNC5BQ8IZJ1 945 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 RCBTB1Q8NDN9 531 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ELOA3Q8NG57 546 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 GPBAR1Q8TDU6 330 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 MAIP1Q8WWC4 291 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 PATE1Q8WXA2 126 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 SEC14L1Q92503 715 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 WBP1Q96G27 269 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 SIGLEC10Q96LC7 697 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 SERPINB12Q96P63 405 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 OR2M4Q96R27 311 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 CARD6Q9BX69 1037 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 TEX101Q9BY14 249 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 SEMA6CQ9H3T2 930 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 MAGEE1Q9HCI5 957 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ARFGAP3Q9NP61 516 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 IL26Q9NPH9 171 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 KCNK4Q9NYG8 393 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 PAK5Q9P286 719 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 SLC17A6Q9P2U8 582 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 SNX24Q9Y343 169 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 DSPP15924 2871 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ZZEF1O43149 2961 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 PRR19A6NJB7 356 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 CCDC188H7C350 402 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 B4GAT1O43505 415 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 SLC28A2O43868 658 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 SNX2O60749 519 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ANXA9O76027 345 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 CEACAM5P06731 702 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 PYGLP06737 847 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 MYBL2P10244 700 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 EPXP11678 715 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 PLA2G2AP14555 144 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF30P17039 623 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 HLA-DPA1P20036 260 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 CES1P23141 567 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 MSNP26038 577 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 NMBRP28336 390 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 FDFT1P37268 417 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ADH7P40394 386 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ETV5P41161 510 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 MAPK9P45984 424 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 GPR3P46089 330 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ATRXP46100 2492 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 BASP1P80723 227 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 TMPRSS15P98073 1019 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 B4GALNT1Q00973 533 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ACVR1Q04771 509 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 NFATC3Q12968 1075 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 NKAIN2Q5VXU1 208 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 IZUMO3Q5VZ72 239 aa5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 PIANPQ8IYJ0 282 aa5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms