RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 KCND1Q9NSA2 647 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 SLC24A2Q9UI40 661 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 TRHDEQ9UKU6 1024 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 KLHL33A6NCF5 533 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 PRAMEF1O95521 474 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 TPM1P09493 284 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 IL10RAQ13651 578 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 GPR19Q15760 415 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 CPZQ66K79 652 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM126BQ8IUX1 230 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 VSTM4Q8IW00 320 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 SLC38A9Q8NBW4 561 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 HAUS1Q96CS2 278 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 FSD1LQ9BXM9 530 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 RSPH14Q9UHP6 348 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 ALG6Q9Y672 507 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 ARL5AQ9Y689 179 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 OR6C74A6NCV1 312 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 HACD1B0YJ81 288 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 AGTP01019 485 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 GPS2Q13227 327 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 BCL7AQ4VC05 210 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 TMTC4Q5T4D3 741 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 IZUMO3Q5VZ72 239 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 ARMC6Q6NXE6 501 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 NAT14Q8WUY8 206 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 MR1Q95460 341 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 MLXIPLQ9NP71 852 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 LATS2Q9NRM7 1088 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 BTRCQ9Y297 605 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 MED13Q9UHV7 2174 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 BLACEA4D250 179 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 TTLL8A6PVC2 850 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 SGTAO43765 313 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP24.28■■□□□ 1.483e-7■■■■■ 46.6
PTPRF-216ENST00000617451 SLC35G4P0C7Q5 338 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 LPOP22079 712 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 PGDP52209 483 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 HADHBP55084 474 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 CHAF1BQ13112 559 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 KATNAL2Q8IYT4 538 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 RCOR2Q8IZ40 523 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 PPM1MQ96MI6 270 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 LRFN5Q96NI6 719 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 SLC25A23Q9BV35 468 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 ING2Q9H160 280 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 GOLPH3Q9H4A6 298 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 ARGFXA6NJG6 315 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 C2orf81A6NN90 581 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 SRP72O76094 671 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 PYGMP11217 842 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
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PTPRF-216ENST00000617451 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 OR4K2Q8NGD2 314 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 RMDN2Q96LZ7 410 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 GORASP1Q9BQQ3 440 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 FICDQ9BVA6 458 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 GBA3Q9H227 469 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 CHST8Q9H2A9 424 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 ASB8Q9H765 288 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 ACSS2Q9NR19 701 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 SOHLH2Q9NX45 425 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 FAM8A1Q9UBU6 413 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRF-216ENST00000617451 SPTBP11277 2137 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 ICE1Q9Y2F5 2266 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 VPS4BO75351 444 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 ANXA9O76027 345 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
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PTPRF-216ENST00000617451 UQCRFS1P47985 274 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 CCL11P51671 97 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 GEMP55040 296 aa24.26■■□□□ 1.47
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PTPRF-216ENST00000617451 GSE1Q14687 1217 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 RANBP10Q6VN20 620 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 CFAP206Q8IYR0 622 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 GALNT11Q8NCW6 608 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 OR4E2Q8NGC2 313 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 CPT1CQ8TCG5 803 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 FKBPLQ9UIM3 349 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 POMT2Q9UKY4 750 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 VPS4AQ9UN37 437 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 NOTCH2Q04721 2471 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 C5orf60A6NFR6 353 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 AGAP14A8MT82 685 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRF-216ENST00000617451 MEN1O00255 615 aa24.25■■□□□ 1.47
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