RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768		Q6ZSR6	202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PARG	Q86W56	976 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	SFR1	Q86XK3	245 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	BLID	Q8IZY5	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PBK	Q96KB5	322 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ACBD6	Q9BR61	282 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	SUN2	Q9UH99	717 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	KPNA7	A9QM74	516 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CPLX1	O14810	134 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	TLR5	O60602	858 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	IL1B	P01584	269 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	STS	P08842	583 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	YWHAQ	P27348	245 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	GNA11	P29992	359 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	HLA-F	P30511	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CSNK1G2	P78368	415 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	FOXF2	Q12947	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	RAPSN	Q13702	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PPP2R5A	Q15172	486 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CHRNA6	Q15825	494 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PGS1	Q32NB8	556 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	VSTM1	Q6UX27	236 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	TRIM69	Q86WT6	500 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ARL10	Q8N8L6	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	INPP5D	Q92835	1189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	RFK	Q969G6	155 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	IFT74	Q96LB3	600 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	LRRC61	Q9BV99	259 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	DDA1	Q9BW61	102 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	NUDT9	Q9BW91	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CLPB	Q9H078	707 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	LIME1	Q9H400	295 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	EHD2	Q9NZN4	543 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	POM121B	A6NF01	834 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768		A6NL46	340 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768		A6NNZ2	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	LMO7DN	F2Z398	122 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768		F5H697	171 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	TIMM44	O43615	452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	STK17B	O94768	372 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	LYPLA2	O95372	231 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	HMBS	P08397	361 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	CLTA	P09496	248 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	ELFN1	P0C7U0	828 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	GPD1	P21695	349 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	AKT2	P31751	481 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	NUDT1	P36639	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	NEK2	P51955	445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	MAP2K6	P52564	334 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	PEX3	P56589	373 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MLH1-223	ENST00000616768	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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