RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612928.1

5S_rRNA.16-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 119 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PSMD11O00231 422 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CLDN5O00501 218 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CXCR6O00574 342 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TOR1BO14657 336 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 BCKDKO14874 412 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MUSKO15146 869 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 IRAK2O43187 625 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RGS10O43665 173 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 IDH3BO43837 385 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GPR32O75388 356 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PMPCBO75439 489 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ECI2O75521 394 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 UGT2B17O75795 530 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RPP40O75818 363 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RECQL4O94761 1208 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KRT75O95678 551 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GLP2RO95838 553 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GOT2P00505 430 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MT-ND1P03886 318 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MT-ND2P03891 347 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 VTNP04004 478 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SEMG1P04279 462 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TXNP10599 105 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SLC2A3P11169 496 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TSPAN8P19075 237 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CXCR2P25025 360 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RCVRNP35243 200 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DDOSTP39656 456 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CHRNA4P43681 627 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PPP3CCP48454 512 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KRT6CP48668 564 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LHX1P48742 406 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PRIM2P49643 509 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CLK3P49761 638 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RENBPP51606 427 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ARSDP51689 593 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 UGT2B15P54855 530 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MAP3K7CLP57077 242 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 VBP1P61758 197 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NCS1P62166 190 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ADAM17P78536 824 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CYP4F3Q08477 520 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 VAC14Q08AM6 782 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RAPSNQ13702 412 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 IHHQ14623 411 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MFSD10Q14728 455 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PON2Q15165 354 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PFKFB4Q16877 469 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PROX2Q3B8N5 592 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TTLL9Q3SXZ7 439 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FUT11Q495W5 492 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FBXO43Q4G163 708 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 UBXN11Q5T124 520 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LRIF1Q5T3J3 769 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CCNJQ5T5M9 372 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TMEM236Q5W0B7 351 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 STEAP3Q658P3 488 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CPZQ66K79 652 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LAIR1Q6GTX8 287 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CES5AQ6NT32 575 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MRNIPQ6NTE8 343 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ZNF544Q6NX49 715 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ERAP2Q6P179 960 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 C19orf48Q6RUI8 117 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CYP20A1Q6UW02 462 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ENPP6Q6UWR7 440 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 USP43Q70EL4 1123 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GDPD3Q7L5L3 318 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CCDC190Q86UF4 302 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TAC4Q86UU9 113 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ZBTB46Q86UZ6 589 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CYP4Z1Q86W10 505 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MICU2Q8IYU8 434 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 METTL4Q8N3J2 472 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FBXO39Q8N4B4 442 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CPA6Q8N4T0 437 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PAF1Q8N7H5 531 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 AMER2Q8N7J2 671 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 OR2T12Q8NG77 320 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 OR52K2Q8NGK3 314 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PPTC7Q8NI37 304 aa4.43□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms