RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611151.4

RAB18-208, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, human

TSL 5 BASIC

Gene RAB18, Length 4,931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB18-208	ENST00000611151	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	LRRC37A3	O60309	1634 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	PIR	O00625	290 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	PIP5K1B	O14986	540 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	GSC2	O15499	205 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	HOXD13	P35453	343 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	FAM171B	Q6P995	826 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	FETUB	Q9UGM5	382 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151		K7EPI3	171 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	INPPL1	O15357	1258 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	IFNG	P01579	166 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	MASP1	P48740	699 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	C1QTNF8	P60827	252 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	RAB14	P61106	215 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	GHRHR	Q02643	423 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	HPS6	Q86YV9	775 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	MPP4	Q96JB8	637 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	SH3GL2	Q99962	352 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	RNF186	Q9NXI6	227 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	TIPRL	O75663	272 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	PRR5	P85299	388 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	TEAD2	Q15562	447 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	KRT77	Q7Z794	578 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	TYR	P14679	529 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	GATM	P50440	423 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	OGDH	Q02218	1023 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	BANP	Q8N9N5	519 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	ENKUR	Q8TC29	256 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	EBPL	Q9BY08	206 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151		G3V2T6	193 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	BEND5	Q7L4P6	421 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	LIX1	Q8N485	282 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	MGRN1	O60291	552 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	MTX2	O75431	263 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	LIPE	Q05469	1076 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	ANKRD46	Q86W74	232 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	CYP4B1	P13584	511 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	FOXM1	Q08050	763 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	CYP4F3	Q08477	520 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	HSPB3	Q12988	150 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	MYLK3	Q32MK0	819 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	TMC8	Q8IU68	726 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	UBR7	Q8N806	425 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	LPGAT1	Q92604	370 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	IRF7	Q92985	503 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	RAD9A	Q99638	391 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	IFNW1	P05000	195 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAB18-208	ENST00000611151	RYK	P34925	604 aa		13.58	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms