RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 ODF2Q5BJF6 829 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM69BQ5VUD6 431 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 OR8K5Q8NH50 307 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 FCRL5Q96RD9 977 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJC7Q99615 494 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 TLR10Q9BXR5 811 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 LATS2Q9NRM7 1088 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 SOHLH2Q9NX45 425 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 BTRCQ9Y297 605 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 MGAT4DA6NG13 374 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 AKR1B10O60218 316 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 CST8O60676 142 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 HLA-DPA1P20036 260 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 MSH3P20585 1137 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 ADCY2Q08462 1091 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 ABRQ12979 859 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 TAZQ16635 292 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 ARMC6Q6NXE6 501 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 RHOT2Q8IXI1 618 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF567Q8N184 647 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2L2Q8NH16 312 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 SSC4DQ8WTU2 575 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 LRFN5Q96NI6 719 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 SPTLC3Q9NUV7 552 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 LUZP4Q9P127 313 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 MEN1O00255 615 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 CEACAM4O75871 244 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 PRAMEF1O95521 474 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 TMTC4Q5T4D3 741 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 KAZNQ674X7 775 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 PID1Q7Z2X4 250 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 DSELQ8IZU8 1212 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 CARFQ8N187 725 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF398Q8TD17 642 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFPM2Q8WW38 1151 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 RMDN2Q96LZ7 410 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 SNX7Q9UNH6 387 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 ARL5AQ9Y689 179 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 LCA5LO95447 670 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB40ALP0C0E4 278 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC35G4P0C7Q5 338 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 RORAP35398 523 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 GSDMDP57764 484 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 TFDP2Q14188 446 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 Q8NA96 180 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 FDCSPQ8NFU4 85 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 OR8K1Q8NGG5 319 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 CPT1BQ92523 772 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 CHP1Q99653 195 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 POMT2Q9UKY4 750 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 TCFL5Q9UL49 500 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 ACSL5Q9ULC5 683 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 STX7O15400 261 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 SGTAO43765 313 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM63AO94886 807 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 COMTP21964 271 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC1A1P43005 524 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 ITGA1P56199 1179 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 MPP3Q13368 585 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 BCL7AQ4VC05 210 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF789Q5FWF6 425 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 DAAM2Q86T65 1068 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4E2Q8NGC2 313 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 HAUS1Q96CS2 278 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 NUDT9Q9BW91 350 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 MFRPQ9BY79 579 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 TEX15Q9BXT5 2789 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 POLBP06746 335 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 CAPN1P07384 714 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 CDH3P22223 829 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM198BQ6UWH4 519 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 OR1L3Q8NH93 324 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 P3H4Q92791 437 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 CLIP3Q96DZ5 547 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 VAT1Q99536 393 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 FSD1LQ9BXM9 530 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 NLNQ9BYT8 704 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 FANCEQ9HB96 536 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 PCMTD2Q9NV79 361 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-211ENST00000590874 RSPH14Q9UHP6 348 aa24.94■■□□□ 1.58
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