RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587260.1

NFIX-208, Transcript of nuclear factor I X, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NFIX, Length 1,537 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIX-208ENST00000587260 EMCNQ9ULC0 261 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 VILLO15195 856 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 PLIN3O60664 434 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 TSPAN12O95859 305 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 FTH1P02794 183 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 CFIP05156 583 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 ACP5P13686 325 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 AOAHP28039 575 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 GMPRP36959 345 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 WDR4P57081 412 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 SRP54P61011 504 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 OVGP1Q12889 678 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 GBX1Q14549 363 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 CCDC6Q16204 474 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 AGAP9Q5VTM2 703 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 HID1Q8IV36 788 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 TMEM151AQ8N4L1 468 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 ZBTB2Q8N680 514 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 KCTD4Q8WVF5 259 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 NXNL1Q96CM4 212 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 TSNARE1Q96NA8 513 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 DERL2Q9GZP9 239 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 NMRAL1Q9HBL8 299 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 DNAJC28Q9NX36 388 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 TMEM216Q9P0N5 145 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 SLC17A7Q9P2U7 560 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 GPSM3Q9Y4H4 160 aa14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 PATE3B3GLJ2 98 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 EPN2O95208 641 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 RASGRP1O95267 797 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 PROCP04070 461 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 APOA4P06727 396 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 CBSLP0DN79 551 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 CD1DP15813 335 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 CCR7P32248 378 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 CBSP35520 551 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 MDH1P40925 334 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 IL2P60568 153 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 ATP6V0D1P61421 351 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 PPARDQ03181 441 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 CSHL1Q14406 222 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 ACAP2Q15057 778 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 OTOAQ7RTW8 1153 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 ANKRD42Q8N9B4 389 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 ELMO1Q92556 727 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 SKA1Q96BD8 255 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 FAM111AQ96PZ2 611 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 OR2M4Q96R27 311 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 CCM2Q9BSQ5 444 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 SMOC1Q9H4F8 434 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 RMI1Q9H9A7 625 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 ZNF358Q9NW07 568 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 KLF15Q9UIH9 416 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NFIX-208ENST00000587260 KLHL33A6NCF5 533 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 TARM1B6A8C7 271 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 TNFRSF10CO14798 259 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 GPC4O75487 556 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 RBP1P09455 135 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 DGKAP23743 735 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 MPLP40238 635 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 KIF19Q2TAC6 998 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 TTLL9Q3SXZ7 439 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 TUBB8Q3ZCM7 444 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 SYTL3Q4VX76 610 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 PYCR3Q53H96 274 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 KLC3Q6P597 504 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 LVRNQ6Q4G3 990 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 C11orf96Q7Z7L8 435 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 ISCA2Q86U28 154 aa14.64□□□□□ -0.07
NFIX-208ENST00000587260 PHACTR4Q8IZ21 702 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms