RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586299.1

CYTH1-206, Transcript of cytohesin 1, human

Gene CYTH1, Length 4,423 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CYTH1-206	ENST00000586299	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299		A0A0D9SEW6	157 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	ILVBL	A1L0T0	632 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	MATN2	O00339	956 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	MAG	P20916	626 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	ERVK-8	P63133	956 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	CHSY3	Q70JA7	882 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	MYDGF	Q969H8	173 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299		Q9Y3F1	56 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299		A0A088AWK7	358 aa		13.77	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	GSAP	A4D1B5	854 aa		13.77	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	IGFBP4	P22692	258 aa		13.77	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	MACC1	Q6ZN28	852 aa		13.77	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		13.77	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		13.77	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		13.77	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		13.77	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		13.77	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		13.77	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	TPK1	Q9H3S4	243 aa		13.77	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	TLE6	Q9H808	572 aa		13.77	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		13.77	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		13.77	□□□□□ -0.2
CYTH1-206	ENST00000586299		K7EPI3	171 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	BCKDK	O14874	412 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	SERPINB7	O75635	380 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	ANGPTL1	O95841	491 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	DLG1	Q12959	904 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	LPIN1	Q14693	890 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	POC5	Q8NA72	575 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	SKA1	Q96BD8	255 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	ZNF570	Q96NI8	536 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	NOBOX	O60393	691 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	TSC22D2	O75157	780 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	AMD1	P17707	334 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	PSMD8	P48556	350 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	UGT2B15	P54855	530 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	ANO7	Q6IWH7	933 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	LUZP2	Q86TE4	346 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	GIPC3	Q8TF64	312 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	TCF25	Q9BQ70	676 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	SERHL	Q9NQF3	203 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	MTMR11	A4FU01	709 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	CLDN7	O95471	211 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	CHRNA6	Q15825	494 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	SNX20	Q7Z614	316 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	C8orf48	Q96LL4	319 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	NUMA1	Q14980	2115 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	CXCR6	O00574	342 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	KERA	O60938	352 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	SLC7A1	P30825	629 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	CSNK2B	P67870	215 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	GPR17	Q13304	367 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	EMC10	Q5UCC4	262 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	PARG	Q86W56	976 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	ACD	Q96AP0	544 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	LRRC58	Q96CX6	371 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	ZNF599	Q96NL3	588 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CYTH1-206	ENST00000586299	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		13.76	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms