RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 CCNG2Q16589 344 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 METRNLQ641Q3 311 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ANKS6Q68DC2 871 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ARMC6Q6NXE6 501 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 KLHL35Q6PF15 583 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 FAM92BQ6ZTR7 304 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 SERPINA9Q86WD7 417 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 IL22RA1Q8N6P7 574 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 OR2L2Q8NH16 312 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 RTP4Q96DX8 246 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ZDHHC12Q96GR4 267 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 C9orf72Q96LT7 481 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 C12orf66Q96MD2 445 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 TTC1Q99614 292 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CTRCQ99895 268 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 TSPYL1Q9H0U9 437 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 VPS37BQ9H9H4 285 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 SDK2Q58EX2 2172 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 OR51F1A6NGY5 319 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 PRR19A6NJB7 356 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 AGAP14A8MT82 685 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 H7C0S8 307 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 K7ENP7 123 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 PRSS56P0CW18 603 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 ADRA1DP25100 572 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 ACRV1P26436 265 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 RPL22P35268 128 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 GRIA1P42261 906 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 KCNJ1P48048 391 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 ARL4DP49703 201 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 GFERP55789 205 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 PRAMEP78395 509 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 MC2RQ01718 297 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 RHDQ02161 417 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 BCL7AQ4VC05 210 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 CACHD1Q5VU97 1274 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 CEACAM20Q6UY09 585 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 VASH2Q86V25 355 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 OR6P1Q8NGX9 317 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 RSC1A1Q92681 617 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 ELMO2Q96JJ3 720 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 FERD3LQ96RJ6 166 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 C19orf43Q9BQ61 176 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 CCM2Q9BSQ5 444 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 DDA1Q9BW61 102 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 TLR10Q9BXR5 811 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 B3GNT4Q9C0J1 378 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 HOMER3Q9NSC5 361 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 PDP2Q9P2J9 529 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 ANAPC5Q9UJX4 755 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 ACSL6Q9UKU0 697 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 BAHCC1Q9P281 2608 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC162PA2VCL2 907 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 MROH6A6NGR9 719 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 F8W8V4 182 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 RAD1O60671 282 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 SUN1O94901 812 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 C9P02748 559 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 NSG1P42857 185 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 CAPZBP47756 277 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 PRLHRP49683 370 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 VPS41P49754 854 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 ARSDP51689 593 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 PRKAA1Q13131 559 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 SEMA5AQ13591 1074 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 BRD3Q15059 726 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 DBN1Q16643 649 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 TSTD2Q5T7W7 516 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 C4orf22Q6V702 233 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 MICALCLQ6ZW33 695 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRM-214ENST00000583153 NLRP9Q7RTR0 991 aa8.13□□□□□ -1.11
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