RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 GABRG3Q99928 467 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208ENST00000573600 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRIM54Q9BYV2 358 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208ENST00000573600 COL4A2P08572 1712 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPC4O75487 556 aa28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208ENST00000573600 CRCPO75575 148 aa28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208ENST00000573600 RASSF9O75901 435 aa28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208ENST00000573600 GUCA1CO95843 209 aa28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208ENST00000573600 PKNOX1P55347 436 aa28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208ENST00000573600 CDKL1Q00532 357 aa28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208ENST00000573600 STARD3Q14849 445 aa28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208ENST00000573600 AGBL4Q5VU57 503 aa28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208ENST00000573600 DLG3Q92796 817 aa28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF382Q96SR6 550 aa28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCM2Q9BSQ5 444 aa28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208ENST00000573600 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208ENST00000573600 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa28.58■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208ENST00000573600 H3BQ06 376 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 GYG2O15488 501 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 KRT16P08779 473 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 KLF10Q13118 480 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMPRSS6Q8IU80 811 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 TEX9Q8N6V9 391 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 ESAMQ96AP7 390 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 RHBDF1Q96CC6 855 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 C19orf60Q96EN9 201 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC12A9Q9BXP2 914 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF385DQ9H6B1 395 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 A0A1W2PPC1 479 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 GRXCR2A6NFK2 248 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 B2RBV5 119 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 C2CD4DB7Z1M9 353 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLCO2B1O94956 709 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANXA5P08758 320 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 CTSCP53634 463 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 NAA25Q14CX7 972 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 TTC23LQ6PF05 361 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 RINLQ6ZS11 566 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 HDDC3Q8N4P3 179 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 TWIST2Q8WVJ9 160 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 ASB11Q8WXH4 323 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 DNASE1L2Q92874 299 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 PARVBQ9HBI1 364 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 TAS2R1Q9NYW7 299 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 WWOXQ9NZC7 414 aa28.57■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 TAPBPO15533 448 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 TM7SF2O76062 418 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 UROSP10746 265 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 DRD1P21728 446 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 RPIAP49247 311 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 GTF2H2Q13888 395 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 BCL7AQ4VC05 210 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM220Q6QAJ8 160 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 TCAIMQ8N3R3 496 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 C1orf21Q9H246 121 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 ASB1Q9Y576 335 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 PIAS3Q9Y6X2 628 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 HIST1H2ADP20671 130 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 COPAP53621 1224 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 RPS14P62263 151 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM196Q5HYL7 178 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 CHSY3Q70JA7 882 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 SYVN1Q86TM6 617 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 PELI3Q8N2H9 469 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLCD3Q8N3E9 789 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 CATSPER2Q96P56 530 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 HIST1H2AJQ99878 128 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 H2AFJQ9BTM1 129 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 CD244Q9BZW8 370 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRIM39Q9HCM9 518 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 PFDN4Q9NQP4 134 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 REV3LO60673 3130 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 GFYI3L273 518 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 K7ESM1 405 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 CHEK2O96017 543 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 CYP2A7P20853 494 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 CPA2P48052 419 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 FOXA1P55317 472 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 TAS2R38P59533 333 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 GTF2H3Q13889 308 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 PON2Q15165 354 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 SYTL3Q4VX76 610 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 C2orf27AQ580R0 203 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 LONP2Q86WA8 852 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 VRK3Q8IV63 474 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms