RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566458.5

RNPS1-220, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RNPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-220ENST00000566458 UFM1P61960 85 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 NTHL1P78549 312 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 UBE3AQ05086 875 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 FOXM1Q08050 763 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 SPATS1Q496A3 300 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 TMEM154Q6P9G4 183 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 BRAT1Q6PJG6 821 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 MILR1Q7Z6M3 343 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 SLC15A3Q8IY34 581 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 AHI1Q8N157 1196 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 FRS2Q8WU20 508 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 ATP6V1E2Q96A05 226 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 LRRC58Q96CX6 371 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 PKP2Q99959 881 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 HEBP1Q9NRV9 189 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 ASPDHA6ND91 283 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 XYLBO75191 536 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 EEDO75530 441 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 HSD17B1P14061 328 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 ZNF30P17039 623 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 SLC6A2P23975 617 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 CCR7P32248 378 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 KCNK10P57789 538 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 EMX2Q04743 252 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 CAMK1Q14012 370 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 GBX1Q14549 363 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 GRAMD1BQ3KR37 738 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 CDKL4Q5MAI5 379 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 IL23RQ5VWK5 629 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 IL27RAQ6UWB1 636 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 RNF165Q6ZSG1 346 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 FNDC5Q8NAU1 212 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 ICA1LQ8NDH6 482 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 CATSPER1Q8NEC5 780 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 ADCY4Q8NFM4 1077 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 PROKR1Q8TCW9 393 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 MRGPRX3Q96LB0 322 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 EGFL8Q99944 293 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 HEPHQ9BQS7 1158 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 APOL5Q9BWW9 433 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 ZMYM5Q9UJ78 669 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 FBXO10Q9UK96 956 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 DTNAQ9Y4J8 743 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 AP4S1Q9Y587 144 aa15.48■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 LSM1O15116 133 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 OR56A5P0C7T3 313 aa15.47■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 MSH3P20585 1137 aa15.47■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 AOAHP28039 575 aa15.47■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 IRS1P35568 1242 aa15.47■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 GDF5P43026 501 aa15.47■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 ABRAXAS2Q15018 415 aa15.47■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 LRRC73Q5JTD7 316 aa15.47■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa15.47■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 MYLIPQ8WY64 445 aa15.47■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 ZUFSPQ96AP4 578 aa15.47■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 MIEF2Q96C03 454 aa15.47■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 SLC45A3Q96JT2 553 aa15.47■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 C1orf50Q9BV19 199 aa15.47■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 NTMT1Q9BV86 223 aa15.47■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 VCXQ9H320 206 aa15.47■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 IL1RL2Q9HB29 575 aa15.47■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 CMTM6Q9NX76 183 aa15.47■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 OPTCQ9UBM4 332 aa15.47■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 SCOCQ9UIL1 159 aa15.47■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 CCL27Q9Y4X3 112 aa15.47■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 WNT6Q9Y6F9 365 aa15.47■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 FAM234BA2RU67 622 aa15.46■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 DPPA5A6NC42 116 aa15.46■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 K7EPI3 171 aa15.46■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 DNAJA2O60884 412 aa15.46■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 KATNA1O75449 491 aa15.46■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 IL12AP29459 219 aa15.46■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 TLR1Q15399 786 aa15.46■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 MAP7D1Q3KQU3 841 aa15.46■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa15.46■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 DHFR2Q86XF0 187 aa15.46■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 VPS33AQ96AX1 596 aa15.46■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 SLCO4A1Q96BD0 722 aa15.46■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 DCUN1D1Q96GG9 259 aa15.46■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 TRIM54Q9BYV2 358 aa15.46■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 ABCG8Q9H221 673 aa15.46■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 SMOXQ9NWM0 555 aa15.46■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 WWOXQ9NZC7 414 aa15.46■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 PKD2L2Q9NZM6 624 aa15.46■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 RWDD3Q9Y3V2 267 aa15.46■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa15.46■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 LAMA3Q16787 3333 aa15.46■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 TSPAN11A1L157 253 aa15.46■□□□□ 0.07
RNPS1-220ENST00000566458 LINC01553A4QN01 128 aa15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms