RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559557.1

MRPS11-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S11, human

TSL 3

Gene MRPS11, Length 447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPS11-208	ENST00000559557	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	APOLD1	Q96LR9	279 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	KXD1	Q9BQD3	176 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	MTRR	Q9UBK8	725 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	STK39	Q9UEW8	545 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557		R4GN57	208 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TMEM131	Q92545	1883 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557		A0A1B0GUV1	79 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557		I6L893	689 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	FAM189A1	O60320	539 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TADA2A	O75478	443 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TMCC1	O94876	653 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	SEC24A	O95486	1093 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	CD72	P21854	359 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68	4e-9	■■■□□ 19.2
MRPS11-208	ENST00000559557	HOXA9	P31269	272 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	OR1D2	P34982	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	NUDT6	P53370	316 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	PEX3	P56589	373 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	OSTN	P61366	133 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ROR1	Q01973	937 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	RHAG	Q02094	409 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TRIM29	Q14134	588 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	MAPK6	Q16659	721 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	SPECC1	Q5M775	1068 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	GPR65	Q8IYL9	337 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	HACE1	Q8IYU2	909 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ADSSL1	Q8N142	457 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	PJA1	Q8NG27	643 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	FGF13	Q92913	245 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	HES6	Q96HZ4	224 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	CCDC138	Q96M89	665 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	KLHL31	Q9H511	634 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	CACNA1B	Q00975	2339 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC16A4	O15374	487 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	B3GAT3	O94766	335 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	SP9	P0CG40	484 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	CXCL8	P10145	99 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	DAO	P14920	347 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	NAGA	P17050	411 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	MUT	P22033	750 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	GSTM2	P28161	218 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	HOXC13	P31276	330 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TNFSF9	P41273	254 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	AMT	P48728	403 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	PMS2	P54278	862 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	STARD6	P59095	220 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	SPAG1	Q07617	926 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	KIF19	Q2TAC6	998 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ZACN	Q401N2	412 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms