RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	TTC4	O95801	387 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	FTH1	P02794	183 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	OR56A5	P0C7T3	313 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	NMBR	P28336	390 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	CRADD	P78560	199 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	CBLB	Q13191	982 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	MAP9	Q49MG5	647 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	PHF19	Q5T6S3	580 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	CASC4	Q6P4E1	433 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	LRRC6	Q86X45	466 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	GPR150	Q8NGU9	434 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	LRRC39	Q96DD0	335 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	MFSD3	Q96ES6	412 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	SNF8	Q96H20	258 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	KRT12	Q99456	494 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	SLC38A3	Q99624	504 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	STRADB	Q9C0K7	418 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	THSD1	Q9NS62	852 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	OR51F1	A6NGY5	319 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	LILRA5	A6NI73	299 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	AVIL	O75366	819 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	VAPB	O95292	243 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	VIP	P01282	170 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	PYGB	P11216	843 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	BRAF	P15056	766 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	ITIH1	P19827	911 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	MPST	P25325	297 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	ETV5	P41161	510 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	CD151	P48509	253 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	TLE3	Q04726	772 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	NFE2L1	Q14494	772 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	DET1	Q7L5Y6	550 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	CLEC14A	Q86T13	490 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	PDIK1L	Q8N165	341 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	OR10G6	Q8NH81	332 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	CALML6	Q8TD86	181 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM159	Q96B96	161 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	PISD	Q9UG56	409 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	POLB	P06746	335 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	ITGA2B	P08514	1039 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	JMJD7	P0C870	316 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	CCL4	P13236	92 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	PGAM1	P18669	254 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	ARNT	P27540	789 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	NDUFS1	P28331	727 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	SLC5A2	P31639	672 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	CSF2RB	P32927	897 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	SLC19A1	P41440	591 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	LIMK2	P53671	638 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	TERF1	P54274	439 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	KIF18A	Q8NI77	898 aa		12.06	□□□□□ -0.48

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