RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 FTLP02792 175 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 PYGMP11217 842 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 BPIP17213 487 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 HLA-DPA1P20036 260 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 UBXN1Q04323 297 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 HADHQ16836 314 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 PTCHD3Q3KNS1 767 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 LDLRAP1Q5SW96 308 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 MLIPQ5VWP3 458 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 FAM180AQ6UWF9 173 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 NXPE1Q8N323 547 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 OR1L3Q8NH93 324 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 DTX3LQ8TDB6 740 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 GRHL3Q8TE85 626 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 NACC2Q96BF6 587 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 ERGIC2Q96RQ1 377 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 CLSTN2Q9H4D0 955 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 CBX8Q9HC52 389 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 P4HTMQ9NXG6 502 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 MYO1AQ9UBC5 1043 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 POMT2Q9UKY4 750 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 ACSL5Q9ULC5 683 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 F8P00451 2351 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-228ENST00000551473 LGALS16A8MUM7 142 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 MMP2P08253 660 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 COX6B1P14854 86 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 CA5AP35218 305 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 CDC16Q13042 620 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 KRT33BQ14525 404 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 ANO6Q4KMQ2 910 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 ZNF789Q5FWF6 425 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 METRNLQ641Q3 311 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 MTFR2Q6P444 385 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 PARP9Q8IXQ6 854 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 NIPA2Q8N8Q9 360 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 CCNYQ8ND76 341 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 OR2Y1Q8NGV0 311 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 DNAJB14Q8TBM8 379 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 PROKR1Q8TCW9 393 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 RELTQ969Z4 430 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 PTERQ96BW5 349 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 HDAC11Q96DB2 347 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 C12orf66Q96MD2 445 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 GBP5Q96PP8 586 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 SYT11Q9BT88 431 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 EPS8L2Q9H6S3 715 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 SLC24A2Q9UI40 661 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 OTOGQ6ZRI0 2925 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 ZNF749O43361 778 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 LCA5LO95447 670 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 SLC35G4P0C7Q5 338 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 PIRTP0C851 137 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 TCF4P15884 667 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 DCDP81605 110 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 ITGA9Q13797 1035 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 NFE2L1Q14494 772 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 GSE1Q14687 1217 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 TLR1Q15399 786 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 SLC14A2Q15849 920 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 LONRF2Q1L5Z9 754 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 VWA2Q5GFL6 755 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 TMEM220Q6QAJ8 160 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 MAP7D3Q8IWC1 876 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 BCORP1Q8N888 145 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 FAM71BQ8TC56 605 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 VPS50Q96JG6 964 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 AGAP4Q96P64 663 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 ZNF670Q9BS34 389 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 AP1M1Q9BXS5 423 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 TRABDQ9H4I3 376 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 IP6K2Q9UHH9 426 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 CCDC66A2RUB6 948 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 GSAPA4D1B5 854 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 AGPSO00116 658 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-228ENST00000551473 HMGCLP35914 325 aa11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms