RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540900.7

NSRP1-206, Transcript of nuclear speckle splicing regulatory protein 1, human

TSL 5

Gene NSRP1, Length 2,057 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSRP1-206	ENST00000540900	PIF1	Q9H611	641 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	MIOS	Q9NXC5	875 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	CDC7	O00311	574 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	SCEL	O95171	688 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	NDST3	O95803	873 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	CHRNA1	P02708	482 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	ITGAM	P11215	1152 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	PCNA	P12004	261 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	MSH3	P20585	1137 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	AGTR2	P50052	363 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	KIAA0040	Q15053	153 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	DGUOK	Q16854	277 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	PARP15	Q460N3	678 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	CADM3	Q8N126	398 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	EID3	Q8N140	333 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	FAR1	Q8WVX9	515 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	ACOX2	Q99424	681 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	SEMA3C	Q99985	751 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	GALP	Q9UBC7	116 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900		M0QZQ0	153 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	BTN3A1	O00481	513 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	OR4F21	O95013	312 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	INMT	O95050	263 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	RET	P07949	1114 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	PGF	P49763	221 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	CXCR4	P61073	352 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	MTA1	Q13330	715 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	SMU1	Q2TAY7	513 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	SH3GL1	Q99961	368 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	RMND5A	Q9H871	391 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	ACTR8	Q9H981	624 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	NMUR1	Q9HB89	426 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	FAM50B	Q9Y247	325 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	ARL5C	A6NH57	179 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	GSTA4	O15217	222 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	XYLB	O75191	536 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	TSPAN12	O95859	305 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	JUND	P17535	347 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	AGXT	P21549	392 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	HOXC8	P31273	242 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	NRIP1	P48552	1158 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	PTPRCAP	Q14761	206 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	NKG7	Q16617	165 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	SETD9	Q8NE22	299 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	GPR21	Q99679	349 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	ENPP3	O14638	875 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	KDM1A	O60341	852 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	VPS26A	O75436	327 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	G6PD	P11413	515 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	FMO4	P31512	558 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	DCT	P40126	519 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	TSPY1	Q01534	308 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	SP3	Q02447	781 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NSRP1-206	ENST00000540900	CDK5R2	Q13319	367 aa		13.41	□□□□□ -0.26

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