RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533811.1

PACS1-214, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-214ENST00000533811 MYBL1P10243 752 aa9□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 GZMAP12544 262 aa9□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 HLA-DPA1P20036 260 aa9□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 AGXTP21549 392 aa9□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 RORAP35398 523 aa9□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 PREPP48147 710 aa9□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 LMAN1P49257 510 aa9□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 CTSCP53634 463 aa9□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
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PACS1-214ENST00000533811 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
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PACS1-214ENST00000533811 GSE1Q14687 1217 aa9□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
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PACS1-214ENST00000533811 ANO6Q4KMQ2 910 aa9□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 CCDC70Q6NSX1 233 aa9□□□□□ -0.97
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PACS1-214ENST00000533811 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 TSGA13Q96PP4 275 aa9□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
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PACS1-214ENST00000533811 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
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PACS1-214ENST00000533811 TMEM63CQ9P1W3 806 aa9□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
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PACS1-214ENST00000533811 ANAPC7Q9UJX3 599 aa9□□□□□ -0.97
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PACS1-214ENST00000533811 BTRCQ9Y297 605 aa9□□□□□ -0.97
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PACS1-214ENST00000533811 E7EQ34 232 aa8.99□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP8.99□□□□□ -0.97
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PACS1-214ENST00000533811 ZNF749O43361 778 aa8.99□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 KCNJ13O60928 360 aa8.99□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 IPO13O94829 963 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 SKILP12757 684 aa8.99□□□□□ -0.97
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PACS1-214ENST00000533811 AKT1P31749 480 aa8.99□□□□□ -0.97
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PACS1-214ENST00000533811 Q6ZS92 163 aa8.99□□□□□ -0.97
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PACS1-214ENST00000533811 DET1Q7L5Y6 550 aa8.99□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 NT5DC3Q86UY8 548 aa8.99□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 KCNMB4Q86W47 210 aa8.99□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
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PACS1-214ENST00000533811 KCTD6Q8NC69 237 aa8.99□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 OR4E2Q8NGC2 313 aa8.99□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 BRSK1Q8TDC3 778 aa8.99□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 GRHL3Q8TE85 626 aa8.99□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
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PACS1-214ENST00000533811 PCM1Q15154 2024 aa8.98□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 APCP25054 2843 aa8.98□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 E2F3O00716 465 aa8.98□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 UGT1A9O60656 530 aa8.98□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PACS1-214ENST00000533811 IGHEP01854 428 aa8.98□□□□□ -0.97
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