RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509876.5

PHF3-210, Transcript of PHD finger protein 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PHF3, Length 7,124 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3-210ENST00000509876 ANKRD22Q5VYY1 191 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 RNF43Q68DV7 783 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 PAQR9Q6ZVX9 377 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 OR4E2Q8NGC2 313 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 TRMOQ9BU70 441 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 FZD4Q9ULV1 537 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 MMP17Q9ULZ9 603 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 ACTL7BQ9Y614 415 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 KLHL41O60662 606 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 KRT75O95678 551 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 AQP5P55064 265 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 AP1S2P56377 157 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 GTF2H2Q13888 395 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 LRP8Q14114 963 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 CPNE9Q8IYJ1 553 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 SPATA6LQ8N4H0 392 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 KDM1BQ8NB78 822 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 GDF15Q99988 308 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 APOOQ9BUR5 198 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 ATG10Q9H0Y0 220 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 EPN3Q9H201 632 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 USP29Q9HBJ7 922 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 LTB4R2Q9NPC1 389 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 TCF7L2Q9NQB0 619 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 ZNF180Q9UJW8 692 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 PADI2Q9Y2J8 665 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 GPR89AB7ZAQ6 455 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 H3BNH8 94 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 PLK4O00444 970 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 HBQ1P09105 142 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 GPR89BP0CG08 455 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 HRH2P25021 359 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 ACRV1P26436 265 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 IL12RB1P42701 662 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 KCNC3Q14003 757 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 PKDCCQ504Y2 493 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 KDM7AQ6ZMT4 941 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 SPEM1Q8N4L4 309 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 CDYL2Q8N8U2 506 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 NELL1Q92832 810 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 GBP5Q96PP8 586 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 TMEM216Q9P0N5 145 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 HCN3Q9P1Z3 774 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 VPS4AQ9UN37 437 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 SBF1O95248 1867 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 GNAZP19086 355 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 RPL10P27635 214 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 RXRGP48443 463 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 COPZ1P61923 177 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 SLC44A3Q8N4M1 653 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 C7orf57Q8NEG2 295 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 SLC44A1Q8WWI5 657 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 LRCH3Q96II8 777 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 MGME1Q9BQP7 344 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 HDAC8Q9BY41 377 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 OSER1Q9NX31 292 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 MUTYHQ9UIF7 546 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 SALL4Q9UJQ4 1053 aa5.05□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa5.04□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 MYO1GB0I1T2 1018 aa5.04□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 AZIN1O14977 448 aa5.04□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 EPN2O95208 641 aa5.04□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 VAV1P15498 845 aa5.04□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 PCSK2P16519 638 aa5.04□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 CNR2P34972 360 aa5.04□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 COPAP53621 1224 aa5.04□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 FGL2Q14314 439 aa5.04□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 ARHGAP40Q5TG30 622 aa5.04□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 TTC27Q6P3X3 843 aa5.04□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 TMEFF1Q8IYR6 380 aa5.04□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 HIPK4Q8NE63 616 aa5.04□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 NAT6Q93015 286 aa5.04□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 PPCDCQ96CD2 204 aa5.04□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 PGM2Q96G03 612 aa5.04□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 SLC39A13Q96H72 371 aa5.04□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 PLEKHA8Q96JA3 519 aa5.04□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 CCT7Q99832 543 aa5.04□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 EFCAB1Q9HAE3 211 aa5.04□□□□□ -1.6
PHF3-210ENST00000509876 PRSS16Q9NQE7 514 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms