RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497842.6

TTC19-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, human

TSL 5

Gene TTC19, Length 1,360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC19-208	ENST00000497842	BANP	Q8N9N5	519 aa		28	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	TMEM159	Q96B96	161 aa		28	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		28	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	MKS1	Q9NXB0	559 aa		28	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		28	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		28	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		28	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	GLRA3	O75311	464 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	CREB1	P16220	341 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	IRF9	Q00978	393 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	LAYN	Q6UX15	382 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	LINGO1	Q96FE5	620 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	CACNA1A	O00555	2505 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842		H3BQF6	201 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	SPAG7	O75391	227 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	KLHL2	O95198	593 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	ACP5	P13686	325 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	CRHR1	P34998	444 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	BLK	P51451	505 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	CSHL1	Q14406	222 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	KLC3	Q6P597	504 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	CLEC14A	Q86T13	490 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	SYT12	Q8IV01	421 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	COG4	Q9H9E3	785 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		27.99	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	GPC4	O75487	556 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	SLCO2B1	O94956	709 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	HOXD12	P35452	270 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	NXPH1	P58417	271 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	DMPK	Q09013	629 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	LRP8	Q14114	963 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	GBX1	Q14549	363 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	PIGK	Q92643	395 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	GLMN	Q92990	594 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	DERL2	Q9GZP9	239 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		27.98	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	27.97	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	GMPR	P36959	345 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	HK3	P52790	923 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	ATP6V0D1	P61421	351 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	RPA4	Q13156	261 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	NFE2L1	Q14494	772 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	NXNL1	Q96CM4	212 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	KLC4	Q9NSK0	619 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	GULP1	Q9UBP9	304 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	TYROBP	O43914	113 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	RAB23	Q9ULC3	237 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	CDYL	Q9Y232	598 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TTC19-208	ENST00000497842	TSPAN12	O95859	305 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	PREP	P48147	710 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	DLG1	Q12959	904 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	METRNL	Q641Q3	311 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		27.95	■■■□□ 2.06

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